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DNA复合条形码在太白山土壤动物多样性研究中的应用

2016-09-21飏,黄

生态学报 2016年14期

宋 飏,黄 原

陕西师范大学生命科学学院,西安 710062



DNA复合条形码在太白山土壤动物多样性研究中的应用

宋飏,黄原*

陕西师范大学生命科学学院,西安710062

DNA复合条形码技术(metabarcoding)将DNA条形码与高通量测序技术相结合,快速便捷地鉴定群落混合样本中的物种,成为监测群落中物种组成和丰富度的可靠方法。采用这一方法分析了秦岭太白山5种不同生境的中小型土壤动物多样性,共得到土壤动物3门9纲28目199科。群落组成分析显示生境的变化对土壤动物群落组成有一定的影响。α多样性分析显示土壤动物群落丰富度指数最高的生境为针叶林,最低的为农田;土壤动物群落多样性指数最高的生境为针叶林,最低的为落叶小叶林。群落相似性分析显示高山草甸、针叶林和农田3种生境的土壤动物群落组成相似性较高,落叶小叶林和落叶阔叶林的土壤动物群落组成与这3种生境的差异较大,落叶小叶林与落叶阔叶林的土壤动物群落组成差异也较大。

DNA复合条形码;太白山;土壤动物;生物多样性

DNA复合条形码技术(metabarcoding)是一种结合了DNA条形码技术和高通量测序技术的快速鉴定混合样本中物种的方法[1-3]。DNA条形码技术通过一段短的DNA序列来鉴定物种,由Hebert等人于2003年提出[4]。传统的Sanger测序只能对单一的DNA分子进行测序,而高通量测序技术可以分别对混合DNA中的每一条DNA分子进行测序。两种技术的结合运用可以获得混合样本中大量的含有分类学信息的DNA片段的序列,然后将这些序列与合适的数据库比对即可确定其代表的类群。……

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