青岛太平湾潮间带趋磁细菌多样性
2016-09-21张文燕陈一然杜海舰潘红苗
徐 丛,张文燕,陈一然,张 蕊,董 逸,杜海舰,潘红苗,肖 天,*
1 中国科学院海洋研究所,海洋生态与环境科学重点实验室, 青岛 266071 2 中国科学院大学, 北京 100049
青岛太平湾潮间带趋磁细菌多样性
徐丛1,2,张文燕1,陈一然1,张蕊1,董逸1,杜海舰1,2,潘红苗1,肖天1,*
1 中国科学院海洋研究所,海洋生态与环境科学重点实验室, 青岛2660712 中国科学院大学, 北京100049
在青岛太平湾潮间带沉积物中发现了一定量的海洋趋磁细菌,最大丰度可达350 个/cm3。透射电镜观察发现该区域趋磁细菌均为趋磁球菌。磁小体个体形状单一,皆是立方体状;磁小体排列方式多样,以链状排列为主,包括单链、双链与多链,也有少数成簇排列。EDS结果表明,磁小体成分为四氧化三铁。据估算,趋磁细菌的铁元素含量(干重)范围在0.40%—6.91%之间,平均为2.19%。通过16S rRNA基因文库的构建与测序得到了47个趋磁细菌序列,分属13个OTU。系统发育分析结果表明,它们都属于α-变形菌纲,其中9个OTU与已知最相似序列的相似性低于97%,有5个OTU与已知最相似序列的相似性低于93%,可能代表了趋磁细菌的9个新种、5个新属,说明该区域潜在的微生物新种质资源十分可观。
潮间带;趋磁细菌;多样性;磁小体;16S rRNA 基因
趋磁细菌(magnetotactic bacteria)是一类能够沿磁力线运动的特殊细菌[1],其形态多样,有单细胞的球菌、杆菌、弧菌、螺旋菌以及多细胞趋磁原核生物[2]。趋磁细菌的趋磁性,源于体内含有的起导向作用的磁小体(magnetosome)与提供运动动力的鞭毛[3]。磁小体通常呈链状排列,有单链、双链以及多链,少数趋磁细菌的磁小体不成链排列[4-5]。……
