孙彩霞，李　明，乔瑞敏，韩雪蕾，李新建（河南农业大学牧医工程学院，郑州　450002）

猪EGFL6基因生物信息学分析

孙彩霞，李明，乔瑞敏，韩雪蕾，李新建*
（河南农业大学牧医工程学院，郑州450002）

为了解猪EGFL6基因基本特性，克隆该基因CDS区，运用生物信息学方法预测分析其氨基酸理化性质、同源性、蛋白功能及二三级结构等。结果表明，猪EGFL6基因CDS区全长1 665 bp，编码554个氨基酸，与人、马、小鼠、绵羊等氨基酸相似性均在75%以上，亲缘关系较近，该蛋白具有亲水性和不稳定性，是分泌蛋白，有12个潜在磷酸化位点，5个保守结构域，无跨膜结构区，无规则卷曲是二三级结构中最主要结构元件。该研究为进一步揭示猪EGFL6基因功能奠定基础。

EGFL6；生物信息学；猪

孙彩霞,李明,乔瑞敏,等.猪EGFL6基因生物信息学分析[J].东北农业大学学报,2016,47(4):16-23.

Sun Caixia,Liming,Qiao Ruimin,et al.Bioinformatics analysis ofEGFL6 gene in pig[J].Journal of Northeast Agricultural University,2016,47(4):16-23.(in Chinese with English abstract)

网络出版时间2016-4-22 10:01:11[URL]http://www.cnki.net/kcms/detail/23.1391.S.20160422.1001.010.html

表皮生长因子样结构域蛋白6（Epidermal growth factor-like domain 6，EGFL6）是类表皮生长因子超家族蛋白成员之一，Yeung等首次发现，证实其位于人的Xp22染色体，因具有MAM结构域，故又命名为MAM[1-2]。人EGFL6蛋白含有553个氨基酸，相对分子质量为6.1×104，包含5个类表皮生长因子结构域和一个羧基端MAM结构域。小鼠、狗、猪的EGFL6基因均有12个外显子组成，位于X染色体；鸡EGFL6基因有12个外显子组成，位于1号染色体，而斑马鱼EGFL6基因有13个外显子组成，位于9号染色体。研究表明，EGFL6基因在一些肿瘤组织如乳腺癌、肺癌、脑脊膜瘤、黑色素瘤和卵巢癌等肿瘤组织呈高表达趋势，尤其是卵巢癌TEC中表达量较高[3-4]。

亢中奎等首次开展人EGFL6基因对肿瘤细胞株A375和SKOV3增殖试验，发现人EGFL6促进A375和SKOV3增殖，但增殖作用机制有待研究[5]；……