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西藏青稞品种藏青13高氮处理的SSH文库构建及分析

2016-09-09徐齐君王玉林原红军曾兴权尼玛扎西

大麦与谷类科学 2016年1期

徐齐君,王玉林,原红军,曾兴权,尼玛扎西*

(1.西藏自治区农牧科学院农业研究所,西藏拉萨850002;2.省部共建青稞种质改良和牦牛繁育国家重点实验室,西藏拉萨850002)

·综述报告·

西藏青稞品种藏青13高氮处理的SSH文库构建及分析

徐齐君1,2,王玉林1,2,原红军1,2,曾兴权1,2,尼玛扎西1,2*

(1.西藏自治区农牧科学院农业研究所,西藏拉萨850002;2.省部共建青稞种质改良和牦牛繁育国家重点实验室,西藏拉萨850002)

为了分析青稞高氮处理相关基因的表达,以藏青13为实验材料,通过抑制差减杂交构建了青稞高氮处理下的差减cDNA文库。在随机挑取的281个阳性克隆中,测序获得219条高质量的EST,含有212条非重复且与Genbank中的基因或蛋白具有较高的同源性的序列。对其进行Blast2Go功能注释可将差异表达的基因定位到细胞组件、分子功能和代谢过程3大类内。通过KEGG代谢途径分析,212个比对结果中的117个ESTs有详细的KO功能注释,定位到17个具体的代谢途径上,且主要定位在光合作用碳固定途径和氮素代谢途径。此外,分析还发现这些基因主要是编码参与结构和功能代谢合成途径中的一些酶,且参与信号转导、转录调节和光合作用等生理过程,说明这些基因很可能参与到青稞在高氮处理下的抗性反应中。关键词:青稞;高氮处理;SSH;EST

网络出版时间:2016-03-18

网络出版地址:http://www.cnki.net/kcms/detail/32.1769.S.20160318.2016.001.html

西藏地区普遍存在着土壤贫瘠、施肥少等严重问题,从而导致农业生产水平低下[1]。青稞(Hordeum vulagare L.)是禾本科小麦族大麦变种之一,主要分布于西藏、青海、甘肃省甘南等藏族自治区,是一种非常重要的高原谷类作物,具有早熟、耐寒、稳产和适应性广等特点,是青藏高原地区的主要粮食作物[2]。……

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