黄春芳，刘建奎，龚丽珍，杨炳辉，曾建平，陈安妮，陈小燕

(福建省龙岩学院生命科学学院，福建省家畜疫病防治与生物技术重点实验室，福建省生猪疫病防控工程技术研究中心，福建龙岩 364000)



2012年-2014年闽西地区PRRSV流行株ORF5基因遗传变异分析

黄春芳，刘建奎*，龚丽珍，杨炳辉，曾建平，陈安妮，陈小燕

(福建省龙岩学院生命科学学院，福建省家畜疫病防治与生物技术重点实验室，福建省生猪疫病防控工程技术研究中心，福建龙岩 364000)

摘要：为了研究2012年-2014年闽西地区猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)流行毒株的分子生物学特性和变异规律，对分离自闽西多个地区25份疑似PRRS病料的10个PRRSV分离株，应用RT-PCR对其中ORF5基因进行扩增及序列分析，从而了解闽西地区PRRSV的遗传变异性。结果表明，10个毒株均为美洲型PRRSV，9株PRRSV ORF5基因全长为603 bp(FJ05为600 bp)，10个毒株ORF5基因之间的核苷酸同源性为88.4%～99.3%；与VR-2332、MLV和CH-1a毒株的核苷酸同源性为88.3%～98.8%，与我国高致病性代表毒株JXA1、WUH1、HUN4等的同源性为88.9%～99.0%，与欧洲型毒株代表毒株LV的同源性为63.8%～65.0%。ORF5基因推导氨基酸序列变异主要发生在9-40位和58-62位，10株PRRSV ORF5氨基酸同源性为88.5%～99.5%；与VR-2332、MLV和CH-1a的氨基酸同源性为87.5%～98.5%，与我国高致病性代表毒株JXA1、WUH1、HUN4等的同源性为88.0%～ 99.5%，与欧洲型毒株代表毒株LV的同源性为56.6%～59.2%。遗传进化树表明，闽西地区PRRSV可以分为疫苗株(1株，10%)、中等毒力PRRSV(1株，10%)和HP-PRRSV(8株，80%)3个亚群，其中以HP-PRRSV为主，表明闽西地区PRRSV流行毒株呈现遗传变异多样性。

关键词：猪繁殖与呼吸综合征病毒；ORF5基因； 反转录-聚合酶链反应；遗传变异

猪繁殖与呼吸综合征(Porcine reproductive and respiratory syndrome，PRRS)是由猪繁殖与呼……