夏眠期仿刺参肠组织实时荧光定量PCR分析中内参基因的筛选❋
2016-08-13张莉恒常亚青包振民
张莉恒, 王 师, 常亚青, 包振民, 丁 君❋❋
(1.大连海洋大学农业部北方海水增养殖重点实验室,辽宁 大连 116023;2.中囯海洋大学海洋生物遗传学与育种教育部重点实验室,山东 青岛 266003)
夏眠期仿刺参肠组织实时荧光定量PCR分析中内参基因的筛选❋
张莉恒1, 王师2, 常亚青1, 包振民2, 丁君1❋❋
(1.大连海洋大学农业部北方海水增养殖重点实验室,辽宁 大连 116023;2.中囯海洋大学海洋生物遗传学与育种教育部重点实验室,山东 青岛 266003)
摘要:在仿刺参(Apostichopus japonicus)正常时期、夏眠初期和中期,应用实时荧光定量PCR技术,检测CA043、dpolm、ro60、grb2、hiat1、nlrc4、farp1、cyc和gapdh 9个候选内参基因在肠组织中的表达稳定性。利用Delta Ct、GeNorm、NormFinder和BestKeeper 4种程序进行统计分析。发现上述条件中,9个候选内参基因在上述条件中的表达稳定性存在一定差异,不同的软件处理分析,得到的基因稳定性排序不完全一致。综合4种程序的方法,筛选出基因grb2表达最稳定,可用作内参基因,其次为基因ro60及dpolm,而表达最不稳定的是CA043,不适宜作为内参基因。本研究为仿刺参中基因表达定量分析奠定了基础,同时为仿刺参中内参基因的选择提供一定参考依据。
关键词:仿刺参;夏眠;内参基因;荧光定量PCR
引用格式:张莉恒, 王师, 常亚青, 等. 夏眠期仿刺参肠组织实时荧光定量PCR分析中内参基因的筛选[J].中国海洋大学学报(自然科学版), 2016, 46(7): 35-43.
ZHANG Li-Heng, WANG Shi, CHANG Ya-Qing, et al. Selection of reference genes for quantitative real-time PCR of Apostichopus japonicus intestine during different periods of aestivation[J].Periodical of Ocean University of China, 2016, 46(7): 35-43.
仿刺参(Apostichopusjaponicus)为中国现有海参中最主要的经济种类,目前已有学者从遗传育种学、发育学和免疫学等多个领域对仿刺参进行了研究,随着分子生物学的发展,对仿刺参的功能基因等分子生物学领域的研究已成为近年来研究热点。……