一种扩展的Post类函数及其对基因调控机制的影响
2016-08-09欧阳宏嘉沈良忠刘文斌
电子学报 2016年7期
许 鹏,欧阳宏嘉,沈良忠,刘文斌
(1.温州大学物理与电子信息工程学院,浙江温州 325035; 2.温州大学城市学院,浙江温州 325035)
一种扩展的Post类函数及其对基因调控机制的影响
许鹏1,欧阳宏嘉1,沈良忠2,刘文斌1
(1.温州大学物理与电子信息工程学院,浙江温州 325035; 2.温州大学城市学院,浙江温州 325035)
已有的理论分析表明,有序函数对网络的运行及其动态行为具有重要的影响.Post类函数是目前发现的数量最大的一种有序函数,其缺点是它仅反映了基因之间的正调控机制.本文在Post类函数的基础上,将其扩展为一种同时具有正负调控机制的函数类.仿真结果表明:扩展的Post类函数在维持网络的有序性及长程相关性方面,和原有的Post类函数以及渠化函数类似.同时与已有的Post类和渠化函数相比,新扩展的Post类函数量最多.从进化的角度,新扩展的函数更有可能成为自然进化选择的调控方式.通过对八种真实生物系统布尔网络模型函数分布的研究,也部分的支持这一结论.
布尔网络;动态行为;Post类函数;基因调控网络
1 引言
基因调控网络的研究已经成为系统生物学的一个热点问题,基因调控网络的模型主要有布尔网络、贝叶斯网络,及微分方程模型等[1].布尔网络模型是一种最简单的模型[2],基因的表达状态为“0”和“1”二种状态,“0”表示抑制或不表达,“1”表示激活或表达.这种模型虽然简单,但是仍然能够反映网络运行过程中复杂的动态行为.已有的研究表明:真实基因调控网络……
登录APP查看全文
