籽用西瓜种质资源SSR分析及初级核心种质库构建
2016-08-06王丰丰孙晓华
石 磊,王 萍,杨 静,王丰丰,孙晓华
(内蒙古农业大学 农学院,内蒙古野生蔬菜种质资源与创新重点实验室,呼和浩特010019)
籽用西瓜种质资源SSR分析及初级核心种质库构建
石磊,王萍*,杨静,王丰丰,孙晓华
(内蒙古农业大学 农学院,内蒙古野生蔬菜种质资源与创新重点实验室,呼和浩特010019)
摘要:采用SSR分子标记技术对50份不同来源的籽用西瓜材料进行遗传多样性研究,并基于SSR分子标记聚类分析采用最小距离逐步抽样法构建籽瓜初级核心种质库。研究表明:(1)从106对SSR随机引物中筛选出扩增条带清晰、多态性高的31对引物,共得到138条清晰可辨条带,其中多态性条带115条,占83.33%,平均Shannon’s信息指数(I)为0.419 3,平均Nei’s多样指数(h)为0.272 4,平均有效等位基因数(Ne)为1.458 0,平均等位基因数(Na)为1.981 4,说明50份籽瓜种质具有丰富的遗传多样性。(2)用NTsys2.10e软件对种质资源聚类分析表明,种质间的遗传相似系数介于0.57~0.91之间,其中来源地相同的个别种质间遗传相似系数却很小,而来源地不同的个别种质间的遗传相似系数却很高。(3)采用最小距离逐步抽样法,按70%、60%、50%、40%、30%、20%、10%的比例抽样后,各个核心子集遗传多样性指数总体上变化不明显,但各抽样比例相比,以抽样比例20%获得10份初选种质的 Ne、 h和 I达到最高值,说明抽样20%构建的初级核心种质对原始种质具有很好的代表性。
关键词:籽用西瓜;SSR分子标记;种质资源;遗传多样性;核心种质
籽用西瓜(Citrulluslanatusssp.vulgarisvar.megalaspermusLin et Chao)简称籽瓜,属于葫芦科普通西瓜亚种中的籽瓜变种,俗称“打瓜”、“瓜籽瓜”,主要以种子为食用器官,常根据种子颜色分为黑籽瓜和红籽瓜两大品种[1]。……
