禾谷炭疽菌GPCR蛋白生物信息学分析
2016-08-03韩长志任文来
韩长志 任文来
(1.西南林业大学林学院,云南省森林灾害预警与控制重点实验室,云南昆明650224;2.廊坊市文安县农业局,河北廊坊065800)
禾谷炭疽菌GPCR蛋白生物信息学分析
韩长志1任文来2
(1.西南林业大学林学院,云南省森林灾害预警与控制重点实验室,云南昆明650224;2.廊坊市文安县农业局,河北廊坊065800)
基于酿酒酵母中已经报道的3个典型GPCR序列,利用B1astP以及关键词对炭疽菌蛋白质数据库进行比对、搜索,通过SMART保守结构域及遗传关系分析。结果表明:发现该菌存在4个典型的GPCR;4个GPCR在蛋白质二级结构上均含有典型的7跨膜结构域以及较高比例的α螺旋结构,均不含有明显的信号肽序列;在定位方面,4个GPCR均定位在质膜上;该菌中的GPCR 与C.higginsianum、C.fioriniae等炭疽菌属中的病菌具有较高的同源序列以及较近的亲缘关系。
禾谷炭疽菌;G蛋白偶联受体;信号肽;二级结构;生物信息学
禾谷炭疽菌 (Colletotrichum graminicola)侵染小麦(Triticum aestivum)、高粱 (Sorghum bicolor)等禾本科作物引起炭疽病,自20世纪70年代以来,由该菌引起的玉米(Zea mays)炭疽病在美国、印度等国就非常普遍,给各国农业造成巨大损失[1-7]。随着该菌全基因组序列的释放[8],目前,关于该菌 MAPK途径蛋白预测[9]、分泌蛋白预测[10]以及14-3-3蛋白[11]和RGS[12]生物信息学分析等已见报道,而关于G蛋白信号通路效应酶的报道尚不多见。G蛋白 (鸟嘌呤核苷酸结合蛋白,Guanine nuc1eotide binding Protein)信号转导途径在植物与病原菌互作过程中,发挥着诸多重要的作用,该系统中用于感知碳源、信息素等外来信号途径中的G蛋白偶联受体(G Protein-couP1ed receP-tor,GPCR),则是接收外源信号、传递信号重要的表面受体[13]。……
