Pim-1蛋白激酶与3,5-二取代吡唑并吡啶衍生物的分子识别研究
2016-07-22胡建平杜文义苟小军
梁 立, 胡建平,2, 杜文义, 左 柯, 刘 嵬, 苟小军
(1.成都大学 药食同源植物资源开发重点实验室, 四川 成都 610106;2.乐山师范学院 化学学院, 四川 乐山 614004)
Pim-1蛋白激酶与3,5-二取代吡唑并吡啶衍生物的分子识别研究
梁立1, 胡建平1,2, 杜文义1, 左柯1, 刘嵬1, 苟小军1
(1.成都大学 药食同源植物资源开发重点实验室, 四川 成都610106;2.乐山师范学院 化学学院, 四川 乐山614004)
摘要:具有丝/苏氨酸激酶活性的Pim-1蛋白激酶(Pim-1 protein kinase,PPK)的过度表达能导致肿瘤的发生,是一个有效的抗肿瘤药物作用靶点.对PPK与3,5-二取代吡唑并吡啶衍生物(3,5-Disubstituted pyrazolopyridine derivatives,DPD)的复合物进行了20 ns的分子动力学模拟,从能量角度分析了二者结合的主要驱动力以及I 185在识别过程中的重要作用,并对复合物体系在模拟过程中的构象变化进行了分析.结果表明,PPK的核心区的保守性是其发挥生理功能的重要机制,模拟结果对基于PPK抑制剂的药物设计具有一定参考作用.关键词: Pim-1蛋白激酶;分子动力学模拟;成簇分析;自由能曲面图;构象变化
0引言
癌症亦称恶性肿瘤,是一类由控制细胞生长增殖机制失常而引起的疾病,是目前威胁人类健康的主要疾病之一[1].研究发现,蛋白激酶通过磷酸化调控蛋白质活性,在细胞信号转导过程中发挥重要作用,其活性异常或过度表达会引发癌症、糖尿病、炎症神经退行性疾病等[2-3].因此,在使用小分子化合物对肿瘤治疗的研究方面,蛋白激酶已成为一个重要的靶点[4].Pim基因最早是作为莫洛尼小鼠白血病病毒的前病毒而被……