李耀深，曹鑫，段明，王俊杰，张彬，李红英，侯思宇,2，韩渊怀,2,3*

(1.山西农业大学 农学院，山西 太谷，030801； 2.杂粮种质资源发掘与遗传改良山西省重点实验室，山西 太谷，030801;3.农业部黄土高原作物基因资源与种质创制重点实验室，山西 太原，030031)



基于荧光检测的糜子Genic-SSR PCR体系优化

李耀深1，曹鑫1，段明1，王俊杰1，张彬1，李红英1，侯思宇1,2，韩渊怀1,2,3*

(1.山西农业大学 农学院，山西 太谷，030801； 2.杂粮种质资源发掘与遗传改良山西省重点实验室，山西 太谷，030801;3.农业部黄土高原作物基因资源与种质创制重点实验室，山西 太原，030031)

摘要：[目的]本研究基于Fragment Analyzer全自动毛细管电泳荧光检测系统，以期建立一个最优的糜子Genic-SSR分子标记PCR反应体系。[方法]试验采用L16(44)正交设计，设计了Taq DNA聚合酶、Mg2+、dNTPs和引物的不同浓度组合，并用Pragment Analyzer全自动毛细管电泳荧光检测系统检测PCR产物。[结果]Taq DNA聚合酶、Mg2+、dNTPs、引物浓度对PCR反应效应为：Mg2+>引物> dNTPs > Taq DNA聚合酶。通过正交实验设计确立了糜子Genic-SSR荧光 PCR检测体系的最佳反应组分：20μL的反应体系中包含0.2 mmol·L-1的dNTPs，0.2μmol·L-1引物，1.5 mmol·L-1的Mg2+和0.5 U的Taq DNA聚合酶。[结论]本研究建立了糜子的Genic-SSR分子标记的最佳荧光PCR反应体系，为糜子种质资源遗传多样性分析中分子标记开发、验证和辅助育种奠定了基础。

关键词：糜子； Genic-SSR； 体系优化； 正交试验设计

糜子(Panicum miliaceumL.)是一年生禾本科黍属作物，民间又称黍、稷和糜，主要种植在干旱半干旱的山区，生育期短。糜子是我国主要米类作物之一，其脱壳之后称为黄米[1]。黄米脂肪含量3.6%左右，蛋白质含量12%左右，必需氨基酸构成比例比较平衡，是很好的辅助食物[2]。同时，……