普通荞麦种内丝裂原活化蛋白激酶序列分析
2016-07-18梁成刚陈晴晴石桃雄陈其皎孟子烨陈庆富
梁成刚, 陈晴晴, 石桃雄, 陈其皎, 孟子烨, 陈庆富
(贵州师范大学 荞麦产业技术研究中心/贵州省荞麦工程技术研究中心,贵州 贵阳 550001)
普通荞麦种内丝裂原活化蛋白激酶序列分析
梁成刚, 陈晴晴, 石桃雄, 陈其皎, 孟子烨, 陈庆富
(贵州师范大学 荞麦产业技术研究中心/贵州省荞麦工程技术研究中心,贵州 贵阳 550001)
摘要:【目的】比较普通荞麦Fagopyrum esculentum种内丝裂原活化蛋白激酶基因(MAPK)序列的差异,研究MAPK基因序列在普通荞麦栽培进化过程中的变化。【方法】以普通荞麦的9个栽培品种和3个落花落果野生种质为材料,PCR特异性扩增获得MAPK基因的保守片段,对基因片段序列进行差异分析和蛋白结构预测。【结果】荞麦MAPK基因cDNA全长为2 835 bp,开放阅读框1 827 bp,编码609个氨基酸,含有TDY的三肽模块,为植物D组MAPK蛋白。PCR扩增获得12个供试材料的MAPK序列,其单型不变位点为723个,多态位点为70个。9个栽培品种间开放阅读框(ORF)区域无序列差异,3个野生种质间ORF区域也无序列差异。栽培品种与野生品种的ORF区域序列含有8个差异位点,编码3个差异氨基酸。其中,ORF区域第13位点组氨酸(H)→酪氨酸(Y)发生置换,导致1个α-螺旋构象发生变化。【结论】普通荞麦MAPK基因序列高度保守,栽培驯化对ORF区域第13位点差异氨基酸的选择具有高度一致性。
关键词:普通荞麦;丝裂原活化蛋白激酶;序列分析;氨基酸位点;蛋白结构
荞麦Fagopyrum起源于中国的西南地区,是我国重要的杂粮作物之一[1]。荞麦具有食药兼用特性,营养价值丰富、药用保健效果较好[2-3]。例如荞麦所富含的黄酮类化合物,尤其是芦丁具有明显的降血糖、降血脂和降血压功效[4]。……
