基于微卫星位点的中国4个野生东方田鼠群体的遗传多样性分析
2016-07-02倪丽菊孙凤萍肖君华周宇荀
上海农业学报 2016年3期
高 骏,倪丽菊,孙凤萍,肖君华,周宇荀,李 凯*
(1东华大学化学化工与生物工程学院,上海201620;2上海市农业科学院畜牧兽医研究所,上海201106;3上海实验动物研究中心,上海201203)
基于微卫星位点的中国4个野生东方田鼠群体的遗传多样性分析
高 骏1,2,倪丽菊3,孙凤萍2,肖君华1,周宇荀1,李 凯1*
(1东华大学化学化工与生物工程学院,上海201620;2上海市农业科学院畜牧兽医研究所,上海201106;3上海实验动物研究中心,上海201203)
摘 要:利用20个微卫星位点,采用荧光-多重PCR分型技术,对4个野生东方田鼠群体(福建、湖南、宁夏、广西)进行遗传结构和遗传分化检测。结果表明:19个微卫星位点显示出高度多态性(PIC=0.83>0.5),平均等位基因数、位点杂合度均显示4个地区野生东方田鼠的遗传多样性丰富。F统计量表明:4个野生东方田鼠群体的遗传差异有13.5%来自于群体间,86.5%的遗传差异主要来源于个体间。遗传距离与UPGMA聚类分析均表明,宁夏群体与广西群体间的遗传分化程度最大,湖南群体与广西群体间的遗传分化程度最小,这在STRUCTURE聚类图分析时(K =2)同样得到提示。分析认为,广西群体与湖南群体间的遗传分化较小,存在一定基因交流的原因是这两个群体间较近的地理距离。
关键词:东方田鼠;微卫星位点;遗传多样性
东方田鼠(Microtus fortis)是我国一种重要的野生实验动物资源,主要分布在我国中东部低海拔地区,以及和我国接壤的俄罗斯、朝鲜、蒙古等地区。东方田鼠具有独特的、天然的抗血吸虫特性[1-2],是一种抗血吸虫病机理研究不可多得的动物材料。……
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