杨沙沙，李颖波，谭何新，郭桂梅，何 婷，陈志伟，刘成洪*，黄剑华*

（1上海海洋大学水产与生命学院，上海201306；2上海市农业科学院生物技术研究所，上海市农业遗传育种重点实验室，上海201106；3第二军医大学药学院，上海200433）



大麦SERK基因家族cDNA克隆及生物信息学分析

杨沙沙1，2，3，李颖波2，谭何新3，郭桂梅2，何 婷2，陈志伟2，刘成洪2*，黄剑华2*

（1上海海洋大学水产与生命学院，上海201306；2上海市农业科学院生物技术研究所，上海市农业遗传育种重点实验室，上海201106；3第二军医大学药学院，上海200433）

摘 要：通过对大麦体细胞胚胎发生受体类蛋白激酶SERK（Somatic embryogenesis receptor-like kinases）基因家族进行注释和基因克隆，得到3条大麦序列，即HvSERK1、HvSERK2和HvSERK3，其中基因HvSERK3与相应已有参考序列（Accession：AK374641）相比，编码氨基酸有所改变。生物信息学分析表明：3条大麦SERK基因都具有1 870 bp左右的开放阅读框，620 aa左右的氨基酸残基数，69 kD左右的相对分子质量大小，平均理论等电点5.5，说明SERK为酸性蛋白；大麦SERK蛋白具有强烈的亲水性，且存在N端信号肽和跨膜螺旋区，二级结构组件主要是环（loop）。本研究为进一步探讨大麦中SERK基因家族的功能奠定了基础。

关键词：大麦；SERK；注释；克隆；生物信息学分析

体细胞胚胎发生受体类蛋白激酶（Somatic embryogenesis receptor-like kinases，SERKs）广泛存在于植物体内，参与调节植物生长发育和各类胁迫响应过程［1］。有关SERK基因的功能已在模式植物拟南芥［2-8］和一些重要禾本科作物如水稻［9-11］、小麦［12］和玉米［13］中都有研究报道，但大麦中有关SERK基因家族的信息还有待研究。

大麦（Hordeum vulgare L.）是仅次于水稻、小麦和玉米的第四大谷类作物，普遍用作麦芽制造、啤酒酿造、饲料生产和食品加工，其适应性广泛，具有较强的耐旱、耐寒和耐盐特性，近年来已成为重要的遗传和生理模式作物［14］。……