打顶期烟草组织基因表达分析及打顶对腋芽基因表达的影响
2016-06-29郭由兵程廷才李开和卢燕回王卫峰夏庆友
中国烟草科学 2016年6期
郭由兵,程廷才,李开和,卢燕回,王卫峰,夏庆友*
(1.家蚕基因组生物学国家重点实验室,西南大学,重庆 400715;2.中国烟草总公司广西壮族自治区公司,南宁 530022)
打顶期烟草组织基因表达分析及打顶对腋芽基因表达的影响
郭由兵1,程廷才1,李开和2,卢燕回2,王卫峰2,夏庆友1*
(1.家蚕基因组生物学国家重点实验室,西南大学,重庆 400715;2.中国烟草总公司广西壮族自治区公司,南宁 530022)
打顶是烟叶生产重要的技术环节之一。为了研究烟草(Nicotiana tabacum)打顶期基因表达模式,选取广西大宁地区晒黄烟现蕾期10个打顶或非打顶的组织样本,构建链特异总RNA测序文库,利用Illumina HiSeq 2000完成测序。通过质量控制,获得9千多万条测序数据,分析获得50 706个基因的表达信息。筛选组织特异和打顶差异表达基因,共富集687个组织特异表达基因和444个腋芽打顶差异表达基因,为烟草组织基因表达模式和打顶分子响应机制研究提供数据支撑,也为调控烟草营养和生殖生长提供分子靶标。
烟草;打顶;转录组;生长调控
烟草(Nicotiana tabacum)是以收获烟叶为主的经济作物,在其营养生长后期,茎顶形成生殖中心,大量营养物质集中到顶端,影响烟叶产量和品质[1]。在烟叶生产过程中,打顶抹杈是抑制生殖生长和促进营养生长的有效措施,将引起烟草植株一系列生理生化响应,如增加营养元素的吸收利用、代谢物质的积累[1-2]。研究人员利用miRNA测序技术分析烟草根部对打顶响应的分子机制,发现打顶差异基因主要涉及激素代谢、转录、应激反应等[3-4]。……
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