MAGE-4抗原MHC-I/MHC-II限制性表位肽的预测
2016-06-22刘晓梁
刘晓梁
山西医科大学汾阳学院科技中心 山西吕梁 032200
MAGE-4抗原MHC-I/MHC-II限制性表位肽的预测
刘晓梁
山西医科大学汾阳学院科技中心山西吕梁032200
[摘要]①目的预测黑色素瘤相关抗原-4(MAGE-4)抗原的MHC-I/MHC-II限制性表位肽。②方法利用NCBI蛋白数据库检索到MAGE-4抗原的氨基酸序列,BIMAS、SYFPEITH1、IEDB等3种方案分别对MAGE-4抗原的HLA-A*0201限制性MHC-I类抗原表位进行预测,选出候选肽;然后利用SYFPEITHI服务器和NetMHCIIpan 3.1服务器对候选肽周围的MHC-II限制性表位进行预测。综合分析选出MHC-I/MHC-II限制性表位肽。③结果筛选得到3条肽段,既存在MHC-I限制性表位又存在MHC-II限制性表位肽。④结论为MAGE-4抗原用于结肠癌免疫治疗肽段的选择提供了依据。
[关键词]黑色素瘤相关抗原-4MHC-I限制性MHC-II限制性免疫治疗
随着生活水平的提高与饮食习惯的改变,我国结肠癌(colorectal cancer,CRC)的发病率越来越高,严重影响着人民的生命健康。而在全球癌症发病率中,CRC居第3位,每年大约有1百万的新增病例。尽管其治疗手段与效果取得了进步,每年仍然导致至少50万人死亡[1]。因此,寻找更为有效的治疗手段,显得颇为重要。生物免疫治疗是被视为继手术、放射治疗、化学治疗之外肿瘤治疗的重要方法之一。研究表明,大部分的肿瘤患者处于免疫抑制状态[2~4]。因此,有效激发患者的免疫功能成为当前研究的热点。细胞免疫在抗肿瘤免疫中起重要作用。在人体内,T细胞仅能识别由抗原性肽段与人类白细胞抗原HLA形成的复合体pMHC。也就是说,具有激发免疫功能的是肿瘤抗原的特异性肽段,而非整个肿瘤抗原分子,该肽段也被称作T细胞表位。……
