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Thermusaquaticus DNA连接酶的连接特性研究❋

2016-06-16梁兴国

中国海洋大学学报(自然科学版) 2016年5期

于 欣, 王 静, 安 然, 梁兴国

(中国海洋大学食品科学与工程学院,山东 青岛 266003)

ThermusaquaticusDNA连接酶的连接特性研究❋

于欣, 王静, 安然, 梁兴国❋❋

(中国海洋大学食品科学与工程学院,山东 青岛 266003)

摘要:为进一步研究Thermus aquaticus (Taq) DNA连接酶的作用机理、开发以DNA连接作为关键步骤的新生物技术,本文以含有超稳定发卡结构的DNA(带有11nt长的单链部分)和另一条单链DNA为连接底物,研究了片段长度、反应温度、连接位点的结构特性、聚乙二醇(Polyethylene glycol, PEG)的添加等对连接的影响,探讨了Taq DNA连接酶的连接特性。连接结果显示:单链DNA的3’端同发卡结构I底物相连的连接率,比单链DNA的5’端同发卡结构II底物相连的连接率更高;可以连接的最短单链DNA片段的长度为6nt;在20~65℃范围内,一般连接率随温度升高而升高。在连接时,由2条底物通过互补配对形成的复合体的热稳定性对连接率影响不大,一般在连接温度远远高于该复合体的熔点(Melting Temperature, Tm)时仍有很高的连接率。在70或75℃时,虽然连接率有所降低,但仍然可以连接9nt的单链DNA片段。研究还发现,在片段连接上,PEG 6000对较难连接的片段(6~7nt)有促进作用,对容易连接的片段(8~10nt)促进作用不显著,甚至有一定抑制作用。

关键词:Taq DNA连接酶;发卡结构;短片段

引用格式:于欣,王静,安然,等. Thermus aquaticus DNA连接酶的连接特性研究[J].中国海洋大学学报(自然科学版), 2016, 46(5): 50-55.

YU Xin, WANG Jing, AN Ran, et al. Investigation of the ligation characteristics of thermus aquaticus DNA ligase[J]. Periodical of Ocean University of China, 2016, 46(5): 50-55.

DNA连接酶在DNA的复制、重组和修复过程中扮演重要角色[1]。它以ATP或NAD+作为辅酶来催化2个DNA链之间的3’-羟基(3’-OH)和5’-磷酸(5’-P)形成磷酸二酯键。这2类连接酶的反应机理相近:(1)NAD+或ATP将其腺苷酰基转移到DNA连接酶赖氨酸残基的ε-氨基上,形成酶-腺苷酸共价复合物中间体,同时释放出烟酰胺单核苷酸(NMN)或焦磷酸;……

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