湖南洞庭湖区12株H9N2亚型AIV全基因序列的进化分析
2016-06-15黄建龙王昌建张朝阳何世成朱春霞汪洪冰邓国华刘道新
黄建龙,谭 丹,,王昌建,张朝阳,何世成,朱春霞,汪洪冰,邓国华,刘道新
(1 湖南省动物疫病预防控制中心, 湖南 长沙 410014;2 中国农业科学院 哈尔滨兽医研究所农业部动物流感重点开放实验室/兽医生物技术国家重点实验室,黑龙江 哈尔滨150001)
湖南洞庭湖区12株H9N2亚型AIV全基因序列的进化分析
黄建龙1,谭丹1,2,王昌建1,张朝阳1,何世成1,朱春霞1,汪洪冰1,邓国华2,刘道新1
(1 湖南省动物疫病预防控制中心, 湖南 长沙 410014;2 中国农业科学院 哈尔滨兽医研究所农业部动物流感重点开放实验室/兽医生物技术国家重点实验室,黑龙江 哈尔滨150001)
[摘要]【目的】 从分子生物学角度了解H9N2亚型禽流感病毒在湖南省洞庭湖区的变异特点和进化规律。【方法】 对近年来洞庭湖区分离的12株H9N2亚型禽流感毒株的全基因进行分段克隆测序,应用Mega 5软件包对病毒基因进行多序列比对和进化树的绘制与分析。【结果】 12株H9N2亚型禽流感毒株HA裂解位点均没有多个连续的碱性氨基酸插入,属于低致病性病毒。12株H9N2亚型禽流感病毒HA、NA基因进化比较同步,均处于DK/HK/Y280/97分支,而6个内部基因(M、PB2、PB1、PA、NA、NS)与高致病性禽流感H5亚型毒株呈现不同程度重组现象,且与H7N9亚型毒株基因的核苷酸同源性很高,很有可能为其提供内部基因。【结论】 湖南省洞庭湖地区H9亚型禽流感病毒的遗传演化较为复杂,存在广泛的基因重组现象。
[关键词]H9N2亚型禽流感;遗传进化; 洞庭湖区;湖南省
禽流感病毒(Avian influenza virus,AIV)为负链单股RNA病毒,由8个基因片段组成,按照片段长度由大到小依次为PB2、PB1、PA、HA、NP、NA、M、NS基因。……