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巨线粒体DNAND6基因克隆及多态性分析

2016-06-14牛宝珍杜民刘艳红白莉艾家灵

江苏农业科学 2016年4期

牛宝珍+杜民+刘艳红+白莉+艾家灵

摘要:利用GenBank数据库中科鱼线粒体ND6基因序列保守区设计引物,采用PCR技术克隆并测序,共得到12尾巨ND6基因全序列。用DNAMAN 5.0软件比对序列,MEGA 5.0软件分析科不同鱼类的进化关系,结果表明:巨ND6基因序列全长为516 bp,碱基含量分别为14.20%、34.50%、40.20%、11.00%,其中“A+T”含量(54.40%)高于“G+C”含量 (45.50%),存在4个单倍型,发生3次颠换;12个个体4个单倍型间的平均相对遗传距离为0.003;将巨与其他14种鱼类的ND6基因用Neighbore-Joining(NJ)法构建系统发育树,发现巨单独聚为1支。研究将为今后鱼类线粒体基因组的研究提供科学依据。

关键词:巨;线粒体;ND6基因;多态性;系统进化

中图分类号: S917.4

文献标志码: A

文章编号:1002-1302(2016)04-0062-04

巨(Bagarius yarrelli Sykes)是云南省特有鱼类,主要分布于元江、澜沧江、怒江流域,属于鲇形目(Siluriforme)科(Sisoridae)属(Bagarius)。巨个体很大,体质量约 50 kg,全身无鳞,皮肤表面布满细密的微小颗粒物,使其皮肤极为粗糙,此外其体表无黏液,身体背面颜色为灰黄色,腹面为白色,肌肉为黄色,所以又称“黄鱼”[1]。巨为底栖肉食性鱼类,具有口宽、上下颌都有齿带、牙齿呈锥形且排列紧密、鳃耙粗短、胃大、肠短等特点,主要食物为鱼类、虾、泥鳅、水生昆虫[2]。田树魁等通过比较巨、叉尾鲇、斑点叉尾3种鱼肌肉中常规营养成分和氨基酸含量,发现巨肌肉中蛋白质、粗脂肪和必需氨基酸的含量比常规鱼类高,是一种具有较高营养价值的有待驯养开发的野生鱼类[3]。杜民等研究表明,野生巨具有较高的遗传多样性[4]。但是由于地理环境的改变和人为因素的影响,野生可利用的巨资源越来越少。……

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