广西全境初步安定下来后，冯子材这时腾出手来，处理一件十分棘手之事。

原来朝廷急召冯子材赴广西就任，首要解决的问题并不是广西这些大大小小的农民反清组织，而是有一件十万火急的事要立马处理。这件头等大事，就是吴亚终领导的反清武装已经成势，上年收编了上思州人刘永福活动在归顺州化垌圩的二百人马，经过广西巡抚带队围剿，这批人现在占据在广西与越南交界的太平、南宁、镇安三府。最近被官家击败，干脆通过多如牛毛的边疆通道退守至越南，把越南的文渊、洛阳等地占为己有。清兵一时无暇顾及，越南派兵驱赶了几次，几员大将都战死，吴亚终更加不把越南放在眼里，在越南设卡收税，如同国中之国。

越南古代在中国版图内，但叛服无常，到了宋朝，才宣布独立。在越南丁氏王朝开国之初，就表示对中国臣服，因此这才有了九百年的中越宗藩关系。

这次吴亚终入越，越南打，打不赢，赶，赶不跑，万般无奈，只得向宗主国搬救兵，呈上文书要清廷派兵镇压。据《越南世系沿革》称，同治七年春，越南国王“咨乞广西巡抚苏凤文代奏，请兵救援。”

吴亚终的人马如果不及时剿灭，发展下去，这些反清武装随时宣布独立，既不利于中越关系，还有分裂国家的危险，这是清廷绝不允许的事，所以才急急下旨冯子材到任广西提督，并“上命提督冯子材率三十营共一万二千一百八十员名进攻。”

冯子材到任后，看到广西的乱象，认为：“攘外必先清内。……