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基于CHD基因利用PCR技术进行鸡早期性别鉴定

2016-05-30吴丽丽周延宾蔡思琪赵建国

热带农业工程 2016年3期

吴丽丽 周延宾 蔡思琪 赵建国

摘 要 为建立鸡早期性别鉴定的快速方法,根据鸡CHD基因在性染色体Z和W上的序列长度差异,从鸡血样中提取基因组DNA,利用2550F/2718R和SF/SR引物分别对鸡CHD基因片段进行PCR扩增,扩增产物经琼脂糖凝胶电泳检测。引物2550F/2718R 的PCR扩增结果显示,公鸡为1条带,约600 bp,母鸡为2条带,分别约为600 bp和450 bp;引物SF/SR PCR扩增结果显示,公鸡为1条带,约500 bp,母鸡为2条带,分别约为500 bp和350 bp;两对引物扩增的条带清晰明亮,特异性强,鉴定的性别与实际性别完全相符。说明本实验建立的PCR方法准确可靠,可用于鸡早期性别鉴定,在生产和科研上有广阔的应用前景。

关键词 CHD ;PCR ;鸡 ;性别鉴定

中图分类号 S836.2

鸡的性别与其价值关系密切,对鸡进行早期性别鉴定具有重要的经济意义。生产上常用翻肛鉴别法和伴性性状鉴别法。翻肛鉴别法必须在出壳后24 h(最好12 h)内进行,而且即使是经验丰富的翻肛员至少也有1.4 %的错误率,且会对雏鸡造成伤害[1]。而伴性性状鉴别法依赖于专门品种或品系之间的杂交,不能通用。随着分子生物学等学科研究的深入,鸟类的性别鉴定已经开发出了PCR方法,可以将鉴定的准确率提高至100 %,而且不受年龄限制,可以实现胚胎期的性别鉴定。染色体螺旋蛋白基因(chromobox-helicase-DNA binding gene,CHD)存在于鸟类性染色体Z和W上,Z染色体上的CHD表示为CHD-Z,W染色体上的CHD表示为CHD-W;因为雌鸟的性染色体组成是ZW型,雄鸟的性染色体组成为ZZ型,所以雌鸟中既含有CHD-Z又含有CHD-W,雄鸟中只有CHD-Z;CHD-Z和CHD-W外显子相似,内含子长度不同[2-4]。通过在CHD基因内含子两侧的保守区设计引物,对样本基因组进行PCR扩增,以CHD-Z和CHD-W为模板扩增出的片段长度不同,公鸡只能扩增出1个片段,而母鸡可以扩增出大小不同的2个片段,根据PCR产物的数量和片段大小可以推测个体的染色体组成,从而判断性别。

1 材料与方法

1.1 材料

刚出壳的海南儋州本地鸡,翼下静脉刺血,收集于已加入抗凝剂的离心管中,-20 ℃保存备用。然后解剖记录每只鸡的性别。选取其中的2只公鸡和2只母鸡的血样进行基因组DNA提取,PCR扩增及电泳检测。

试剂:血液基因组提取试剂盒购自天根生化科技(北京)有限公司,PCR试剂采用全式金super Mix,PCR引物交由上海生物工程技术有限公司合成。

1.2 方法

1.2.1 PCR引物

选用2550F/2718R[5]和SF/SR[6]两对引物分别对4只鸡样本进行PCR性别鉴定。引物序列为:2550F:5′-GTTACTGATTCGTCTACGAGA-3′,2718R:5′-ATTGAAATGATCCAGTGCTTG-3′;SF:5′-AGTGCATTGCAGAAGCAATATT-3′,SR:5′-GCCTCCTGTTTATTATAGAATTCAT-3′。

1.2.2 PCR体系和程序

25 μL体系:模板1 μL,上、下游引物各1 μL,PCR Mix 12.5 μL,ddH2O 9.5 μL。反应程序:94.0 ℃ 5 min;94.0 ℃ 30 s,54.0 ℃ 30 s,72.0 ℃ 40 s,35个循环;72.0 ℃ 7 min,4 ℃保存。

1.2.3 电泳检测

吸取10 μL PCR扩增产物用1.5 %的琼脂糖凝胶电泳检测,在紫外检测仪下观察结果,并拍照记录。

2 结果与分析

2.1 基因组DNA

将提取的鸡基因组DNA用1.0 %的琼脂糖凝胶进行电泳检测。由图1可知,鸡基因组DNA电泳图呈现致密亮带,表明所提DNA质量良好,可用于PCR扩增。

2.2 PCR扩增结果

利用2550F/2718R和SF/SR两对引物分别对鸡基因组DNA进行PCR扩增结果见图2。引物对2550F/2718R PCR扩增产物为:公鸡有1条带,片段长约600 bp,母鸡有2条带,1条片段长度约600 bp,和公鸡相当,另一条片段长450 bp。引物对SF/SR PCR扩增产物为:公鸡有1条约500 bp的条带,母鸡有2条带,1条长度同公鸡相当,约500 bp,另一条约350 bp。PCR性别鉴定结果与已知性别完全吻合,条带清晰明亮,无杂带,证明两对引物都可以特异高效的扩增鸡Z和W染色体的CHD基因片段,PCR体系配比和PCR所设条件适宜,所采用的方法可以准确鉴定鸡的性别。

3 讨论与结论

3.1 利用CHD基因性别鉴定

CHD基因存在许多鸟类中,其进化速率慢,序列非常保守,已成为非平胸类鸟类性别鉴定的分子标记[7]。Griffiths等[2,8]利用CHD基因设计引物P2/P3和P2/P8对约30种鸟类性别进行了准确鉴定;盖玉林等[9]利用CHD基因和引物P2/P8准确鉴定了画眉和红嘴相思鸟的性别;陈蓉等[10]利用CHD基因和引物2550F/2718R对美洲红鹮和火烈鸟的性别进行了准确鉴定;张莉等[11]和吕夕超等[12]分别利用该基因对鸽子和信鸽进行了性别鉴定。

3.2 性别的判定

利用CHD基因进行性别鉴定,以CHD-Z为模板扩增出的条带称为Z带,以CHD-W为模板扩增出的条带为W带。理论上扩增出1条带说明基因组只含有Z染色体,为公鸡,扩增出2条带说明基因组含有Z和W染色体,为母鸡,根据条带的数目即可判断性别。笔者和刘宏祥等[6]研究结果均发现:母鸡样本中Z带和W带的合成存在竞争关系,W带因为较短合成效率较高,更容易扩增出来,在模板质量不好或者反应条件不适宜时,可能出现母鸡基因组扩增不出Z带的情况,所以母鸡样本有时也会出现1条带的情况。在实际操作时,除了通过条带数目还应该观察条带大小进行性别判定,如果PCR产物只有W带,也可判定为母鸡。

3.3 PCR法性别鉴定展望

鸡作为主要经济动物在畜牧生产中一直占有重要地位,为获得不同的产品要对家鸡性别做严格的选择,对鸡胚或雏鸡进行性别鉴定并分流可大大节省人力、物力,降低生产成本。除鸡以外,家鸽、信鸽、大部分鸟类均可以利用该基因进行性别鉴定。PCR方法因为直接检测动物的分子本质,故性别判断的准确率高,且对动物的伤害小,不受发育时期的限制,优势明显。特别对于存在性反转,或者性别分化不明显的个体,作为判定的标准更为适宜。随着实验技术的不断改进,PCR鉴定方法越来越简单、经济、快捷,必将在生产实践中发挥更大的作用。

鸡的性别可以利用CHD基因及引物对2550F/2718R或SR/SF进行准确鉴定。引物对2550F/2718R判断标准为:PCR产物有1条约600 bp条带者为公鸡,有600 bp和450 bp两条带者为母鸡,如果只出现450 bp条带,也可以判定为母鸡。引物对SF/SR判断标准为:PCR产物有1条约500 bp的条带者为公鸡,有约500 bp和350 bp两条带者为母鸡,如果只出现1条约350 bp条带也可以判定为母鸡。两对引物扩增效率高且特异,所设条件适宜,本试验方法可以准确的鉴定鸡早期性别,在生产和科研上有广阔的应用前景。

参考文献

[1] 王晓峰. 鸡胚性别鉴别——家禽科学研究的新视点[J].中国家禽,2003,25(14):23-33.

[2] Griffiths R, Tiwari B. Sex of the last wild Spix′s macaw[J]. Nature, 1995, 375(6531):454.

[3] Griffiths R, Korn R M. A CHD gene is Z chromosome linked in the chicken Gallus domesticus[J].Gene, 1997, 197(1/2):225-229.

[4] Fridolfsson, Daan S, Dijkstra C. Sex identification in birds using two CHD genes[J]. Proc Biol Sci, 1996, 263(1 374):1 251-1 256.

[5] Anna K F, Hans E. A simple and universal method for molecular sexing of non-ratite birds[J]. Avian Biology, 1999, 30:116-121.

[6] 刘宏祥,姬改革,胡 艳,等. 基于性染色体CHD基因序列差异鉴定鸡的性别[J]. 中国家禽,2013,11(22):9-10.

[7] Ellegren H. First gene on the avian W chromosome (CHD) provides a tag for universal sexing of non-ratite birds[J]. Proc Royal Soc London B, 1996, 263(1377):1 635-1 641.

[8] Griffiths R, Double M C, Orr K, et al. A DNA test to sex most birds[J]. Mol Ecol,1998,7(8):1 071-1 075.

[9] 盖玉林,路 迪,周材权. 两种观赏鸟性别的快速鉴定研究[J]. 西华师范大学学报(自然科学版),2014,35(2):166-171.

[10] 陈 蓉,陈 楠,章小小,等. 美洲红鹮和火烈鸟性别的分子鉴定[J]. 畜牧与兽医,2014,46(1):60-62.

[11] 张 莉,单达聪,刘 彦,等. 通过CHD基因快速鉴定鸽子性别方法的研究[J]. 中国畜牧兽医,2016,43(5):1 379-1 384.

[12] 吕夕超,叶 超,纪丝保,等. 通过CHD基因鉴定信鸽性别[J]. 中国畜牧杂志,2015,51(9):12-15.