分子生物学方法在土壤线虫群落研究中的应用
2016-05-14李孟洁张靖楠刘君锋张钰倩
南方农业·下旬 2016年5期
李孟洁 张靖楠 刘君锋 张钰倩
摘 要 线虫群落组成可作为评估土壤环境质量的一个重要指标。分子生物学手段为解决传统形态学鉴定进行群落组成分析工作量较大,专业知识需求高,鉴定结果的一致性易受干扰等问题提供了新途径,并具有样品量小,检测速度快,对近缘种区分度高等特点。
关键词 线虫多样性;高通量测序;DGGE;分子生物学;遗传标记
中图分类号:S154 文献标志码:B 文章编号:1673-890X(2016)15--02
线虫在土壤食物网中占据较为重要的地位,常以土壤微生物为食,在土壤有机质分解、养分循环、改善土壤结构以及植物演替中发挥着重要的作用,其群落组成的变化能够反映所在生态系统的健康状况[1]。
传统的线虫群落结构研究基于对土壤中线虫的人工分离和形态学鉴定,往往需要研究者具备专业的分类学知识,同时耗费大量的时间和精力。而且,由于线虫个体较小,物种的分类比较粗糙,往往只到科属水平,使生态分析比较模糊或表面化。此外,由于提取方法和形态学分类依据的限制,科属鉴定只能针对从土壤中获取的很小一部分成年线虫个体,很难反映全部土壤线虫的状态,且易受环境和人为因素的干扰,可能使后续群落结构和区系分析结果在平行试验结果间缺乏一致性。
针对遗传物质的分子生物学方法在分类学上的引入为解决问题提供了新的方法和思路。不同于传统的形态学鉴定对常规物种描述性的评估,采用分子生物学方法能针对少量样品进行分析,降低了劳动强度和对分类学专业知识的要求,提高了效率。……
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