1.茎点枯病 主要发生于芝麻开花结蒴期。高温高湿有利于病菌侵入和扩展。特别是在雨后骤晴发病重。根部发病后，逐渐变褐枯萎。茎部病斑初呈黄褐色水渍状，与健全组织无明显界线，继而发展为绕茎大斑并蔓延，病斑呈黑褐色、中部银灰色、有光泽、密生针尖大的小黑点。病株叶片自下而上呈卷缩萎蔫状，黑褐色，不脱落，植株顶端弯曲下垂。蒴果发病后呈黑褐色枯死状。防治方法：发病初期喷70%代森锰锌可湿性粉剂800倍液，或50%多菌灵500倍液，或70%甲基托布津可湿性粉剂600倍液，每隔7天喷1次，连喷2～3次，兼治枯萎病。

2.疫病 主要危害叶片、茎秆和蒴果。发病高峰为7～8月，高温高湿病情扩展迅速，大暴雨后或夜间降温有利于发病。叶片发病初期出现褐色水渍状不规则形斑，湿度大时呈黑褐色湿腐状，边缘有白色霉状物，干燥时病斑为黄褐色；茎秆发病初期出现墨绿色水渍状斑，后为深褐色不规则形斑，略凹陷，环绕全茎后病部缢缩，边缘不明显，湿度大时上下扩展，致全株枯死；蒴果病斑呈水渍状墨绿色，后变褐凹陷。防治方法：发病初期喷1∶1∶100的波尔多液，或58%甲霜灵·锰锌可湿性粉剂500～600倍液，或75%百菌清可湿性粉剂600倍液。

3.青枯病 主要危害茎秆、叶和蒴果。发病高峰为7～8月，高温高湿有利于发病，特别是雨后骤晴发病较重。茎秆染病初期出现暗绿色斑块，逐渐成黑褐色条斑，顶梢有2～3个梭形溃疡状裂缝。植株顶端萎蔫，后下部叶片萎蔫，呈失水状，发病轻时夜间尚可恢复，数日后枯死。也有半边植株先萎蔫而另半边暂时维持原状的。根茎维管束呈褐色，最后蔓延至髓部，造成空洞。湿度大时，茎部内外均有菌液溢出，菌液渐变为黑色的颗粒。叶片染病，叶脉呈墨绿色条斑，有时纵横交错，结成网状，叶背脉纹呈黄色凸起，病叶褶皱变褐枯死。蒴果染病外表有水渍状病斑，渐变为深褐色粗细不匀的条斑。防治方法：发现病株及时拔除，并用石灰水泼浇病穴。在发病初期用50%多菌灵可湿性粉剂500～800倍液喷洒防治。

4.叶斑病 危害叶片、蒴果、茎秆，以叶片受害为主。多雨、潮湿条件有利于发病。叶片受害，病斑圆形、近圆形或多角形；边缘黑褐色，中央灰褐色；病斑背面生一层灰黑色霉状物，病斑中央常破裂；严重时，一片叶片上可生几十个病斑。茎上的病斑淡褐色，不规则形，边缘明显。蒴果上的病斑圆形，边缘黑褐色。防治方法：发病初期喷75%百菌清可湿性粉剂1000倍液，或1∶1∶150的波尔多液。每隔7～10天喷1次，连喷2～3次，兼治叶枯病。