2016年7月21日，农业部下发《关于贯彻落实中央领导重要指示精神毫不松懈抓好农业防汛救灾工作的紧急通知》，就做好农业防汛抗灾救灾工作的有关事项通知如下。

1.突出抓好规模种养和设施农业防灾减灾。规模种养和设施农业投入大，遭受严重洪涝灾害损失也很大。要深入灾区摸排情况，分析研判影响，提出支持规模种养和设施农业的措施。多方筹集资金，优先支持规模种养户尽快恢复生产。组织规模化种养大户，加快修复倒塌损毁栏舍和设施大棚，疏通排水通道，加固破损圈舍，做好电路和设备检修。及时为规模养殖户提供种苗、种畜、种禽等供求信息，积极引导发展市场行情好、生产周期短、比较效益高、投资风险小的短平快养殖项目。鼓励灾区农民建立养殖小区或规模养殖场，发展规模化、高标准、无公害畜禽养殖。协助保险公司勘察定损，及时落实理赔资金，增强规模种养户生产恢复的能力。加强农家乐等休闲观光农业的安全监管，完善安全管理预案，配套安全设施，全力保障人员安全。

2.及时抓好灾后生产恢复。洪水退后生产恢复要迅速跟上。要及时抢排田间积水，加强机具、电力和柴油等物资的调度，集中力量抢排低洼地块积水，恢复作物生长环境。搞好肥水调控，针对大水过后田间养分流失较多的情况，及时增施肥料，促进作物正常生长发育。及时改种补种，抓紧抢收已熟早稻，对受淹损失较重的田块，改种补种生育期短、有市场需求的作物，特别是南方双季稻区采取“早翻晚”措施，保证晚稻面积落实。做好救灾备荒种子的调剂调运，保证灾后生产恢复需要。指导受灾养殖场户农户做好畜禽补栏、鱼塘补苗。组织农业部门机关干部和农技人员深入重灾区，进村入户，蹲点包片，指导农民落实好生产恢复的各项措施，做到早稻损失晚稻补、粮食损失经济作物补、种植业损失养殖业补，确保农民收入不减少。

3.全力防控动植物疫病。洪涝灾害极易造成疫病流行，一些多年不发生或很少发生的疫病可能会发生。要组织机关干部和技术人员，深入洪涝重灾区、养殖密集区，指导养殖户对受淹的畜禽圈舍、畜禽用具和养殖水体等进行全面消毒，及时对死亡畜禽进行无害化处理。加强疫情监测，及时调拨动物防疫应急物资，根据当地实际开展紧急强化免疫，消除疫情隐患，确保大灾后无大疫。加强产地和屠宰环节监督检查，严防病死畜禽流入市场，确保上市畜产品安全卫生，保障农产品质量安全。加强病虫监测预警，及时发布病虫信息，适时开展应急防治，大力推进统防统治，遏制病虫扩散蔓延，实现“虫口夺粮”。

4.抓紧修复水毁农田设施。强降雨造成山洪暴发和泥石流，使部分农田损毁。要及时调度农业机具，组织群众将积压砂石转出农田，尽快恢复生产条件。结合划定永久基本农田和土地整治，支持受灾区通过客土再造等措施，恢复耕作层。利用高标准农田建设等项目资金，支持水毁农田修复，重点用于疏浚渠系，修复桥涵泵站和机耕道路等，为尽快恢复农业生产创造条件。充分利用灾后淤泥、农作物秸秆、生活垃圾等废弃物，堆积有机肥，合理配施尿素、生物菌剂，促进有机物腐熟，尽快恢复地力，巩固生产能力。