基于SSR标记的粒用高粱资源遗传多样性及群体结构
2016-04-13周棱波张国兵邵明波张立异
高 旭,周棱波,张国兵,邵明波,张立异
(贵州省旱粱研究所,贵州贵阳550006)
基于SSR标记的粒用高粱资源遗传多样性及群体结构
高 旭,周棱波,张国兵,邵明波,张立异
(贵州省旱粱研究所,贵州贵阳550006)
为粒用高粱资源的科学利用和新品种选育提供参考,利用SSR分子标记对156份全国籽粒高粱进行全基因组基因分型。结果表明:33个SSR分子标记的扫描共获得186条多态性DNA条带。多态指数(PIC,polymorphism information content)值为0.01~0.73,平均值为0.45。材料间遗传相似系数GS(Genetic Similarity)变异范围为0.15~0.9,平均值为0.53。NJ(Neighbor Joining)聚类分析和主坐标分析(PCOA,Principal-Coordinates Analysis)将156份高粱资源划分为3个类群:类群I为来源于贵州、四川和云南的56份南方高粱;类群Ⅱ包含的48份全部是北方高粱,来源于辽宁、内蒙古、山西、北京和河北等地;类群Ⅲ包含52个南方和北方的高粱,来源于黑龙江、吉林、陕西、山东、湖北和云南等地。
籽粒高粱;分子标记;遗传多样性;群体结构
高粱(SorghumbicolorL.Moench)属于禾本科(Gramineae)高粱属(Sorghum)植物,是全世界种植的第五大禾谷类作物。由于高粱具有光合效率高、抗旱、抗涝、耐盐碱、耐瘠薄等多重抗逆性和适应性,因此被作为C4作物的模式作物进行研究。高粱栽培历史久远,分布区域广泛,在全世界范围内均有分布,其中主要分布于热带干旱和半干旱地区[1-3]。根据用途的不同,高粱栽培品种一般分为3种类型:甜高粱(能源用)、饲料高粱(饲用)以及作为粮食的籽粒高粱(食用)。在籽粒高粱中又将直链淀粉含量在0~5%的称为糯高粱[4],主要用作酿酒。在贵州,糯高粱是酿造茅台酒和习酒等酱香型高档白酒的主要原料之一,因而具有重要的经济价值。……
