基于可变数目串联重复序列的结核病分子流行病学研究

孙雪娟 赵振国 邓 平 张 宇 陈中秀 韩晓蓉 谢清波 王 珏

为了解吉林省结核杆菌的基因型多态性，以及各菌株之间的进化关系，本研究提取80例临床患者的结核杆菌基因组对数目可变串联重复序列（VNTR）基因分型进行分析研究。结果显示重复单位（MIRU）及MIRU+乙烯受体蛋白基因（ETR）的成簇菌株比ETR的要少。研究证明，VNTR位点适用于结核杆菌基因分型，VNTR分型可以做为吉林省结核病分子流行病学研究有效方法。

结核杆菌；可变串联重复序列；基因分型；流行病学

结核病属于感染性疾病类型，主要有结核分枝杆菌感染引发，可在感染后长期潜伏于机体中。传统的流行病学方法在预测结核感染状况中有一定的应用价值，但是也受到明显限制。近年来生物和计算机技术的发展为结核感染的诊断、爆发趋势的预测等均提供了全新的契机，优势明显［1］。基于此，本研究特选取80例确诊为结核病的患者实施临床试验，并对其基因组结构状况进行分析，以期为结核分枝杆菌感染的诊断提供依据。

1 材料与方法

1.1 实验菌株

选取吉林省大型综合医院门诊2014年1月～2016年11月收治的80例确诊为结核病患者的临床痰标本作为受试对象，取其痰液标本。

1.2 结核分枝杆菌培养方法

取合格的痰液标本制备成痰涂片，经过抗酸染色后实施镜检。将处理后的标本混合均匀后在7H9液体培养基中进行培养，充分混合均匀后取其中的200μl混合液加入微孔板中，添加50μl石蜡液体在37℃条件下培养，按照颜色变化观察结核分枝杆菌感染情况。……