植物性状整合的不同软件PCA比较分析
2015-12-21杨韫嘉刘卫东关文彬
乐 也 ,王 青,杨韫嘉,徐 欢 ,刘卫东 ,关文彬
(1.北京林业大学 自然保护区学院,北京 100083;2.中南林业科技大学,湖南 长沙 410004)
植物性状整合的不同软件PCA比较分析
乐 也1,王 青1,杨韫嘉1,徐 欢1,刘卫东2,关文彬1
(1.北京林业大学 自然保护区学院,北京 100083;2.中南林业科技大学,湖南 长沙 410004)
品种鉴定、选优评价、性状可塑性研究等需要对多个性状整合,通过降维处理解决多个性状的计算难题,而诸多研究采用统计学软件对性状的整合分析,并未取得理想结果。以文冠果营养器官的性状指标(根插幼苗的生长性状、分配性状)和生殖器官的性状指标(花朵性状、花序性状)为例,应用康奈尔生态软件Canoco和SPSS两种统计软件,进行主成分PCA分析。结果证实:多元性状的整合,Canoco-PCA明显优于SPSS-PCA,其原因在于前者原始数据的标准化采用中心化,而后者采用离差标准化;以 Canoco-PCA前2个排序轴作因变量、性状作自变量进行双重筛选逐步回归,给出的方程可用于性状评价、可塑性研究等,为植物性状整合提供了一个新的计算方法。
植物性状整合;主成分分析(PCA);Canoco生态统计软件;SPSS生态统计软件;文冠果
功能性状是生态学、遗传学、进化生物学的重要主题之一[1-4]。在生物数量性状遗传与表型可塑性研究中,多元表型性状的量化整合方法一直是困扰研究人员的重要问题[1,5]。通常采用的CPC(common principal components)分析是不令人满意的[6-7],而采用多性状的PCA[8]第一主成分可以进行表型可塑性计算,但其整合的效果也欠佳[9-10]。
本研究用文冠果Xanthoceras sorbifolium根扦插减光实验……
