真核生物FANCJ-like蛋白的结构与进化
2015-12-02吉克伍合武泽峰范三红奚绪光
吉克伍合,武泽峰,范三红,2,奚绪光
真核生物FANCJ-like蛋白的结构与进化
吉克伍合1,武泽峰1,范三红1,2,奚绪光1
1. 西北农林科技大学生命科学学院,杨凌 712100;2. 旱区作物逆境生物学国家重点实验室,杨凌 712100
FANCJ-like蛋白是一类ATP依赖的5′-3′DNA解旋酶,参与DNA损伤修复、同源重组及G4-DNA拆解,在基因组稳定性维持过程中发挥重要功能。文章系统分析了47种真核生物的FANCJ-like蛋白,对其序列结构特征及起源进化进行了深入探讨。真核生物FANCJ-like蛋白包含4类成员——XPD、CHL1、RTEL1和FANCJ,但在真菌的一些世系及昆虫中存在严重缺失现象,如接合菌门(Zygomycota)缺失了RTEL1,担子菌门(Basidiomycota)和子囊菌门(Ascomycota)缺失了RTEL1和FANCJ,双翅目昆虫缺失了FANCJ。FANCJ-like蛋白不仅包含经典解旋酶共有HD1和HD2结构域,而且在HD1结构域中插入了自身特有的Fe-S、Arch和Extra-D结构域。Fe-S和Arch结构域在4类成员中较保守,Extra-D结构域在XPD中不存在,在其他3类成员中也各不相同。在FANCJ-like蛋白的Fe-S、Arch和Extra-D结构域中分别发现了7个、10个和2个特有模体;除了已报道的保守模体外,HD1和HD2中分别发现了5个和12个特有模体。从这些特有模体的组成和排布来看,RTEL1和FANCJ最为相近,它们在HD2区包含两个独有模体Vb2和Vc,可能与其G4-DNA解旋活性相关。进化方面的证据表明,FANCJ-like蛋白起源于一种HD1区插入了Fe-S和Arch结构域的DNA解旋酶,在多细胞真核生物出现之前,该蛋白通过3次复制事件和随后的特异化过程,依次形成了目前真核生物所包含的4类FANCJ-like蛋白。
FANCJ-like蛋白;解旋酶;系统发育;保守模体;空间结构
FANCJ(Fanconi anemia complementation group J)是一种ATP依赖的5′-3′DNA解旋酶,其突变体最初是从范可尼贫血症[1~3]和早发性乳腺癌患者[4]中鉴定出来,暗示FANCJ蛋白可能作为肿瘤抑制因子维持基因组的稳定性。……
