CYP2C19显色型基因芯片的研究
2015-11-24邢军芬汪涛张莹朱滨
中国医药生物技术 2015年1期
关键词:检测
邢军芬,汪涛,张莹,朱滨
·论著·
CYP2C19显色型基因芯片的研究
邢军芬,汪涛,张莹,朱滨
目的提供一种基于显色原理的CYP2C19基因芯片诊断方法。
方法采用碱性磷酸酶促显色原理设计制备固定有*2、*3检测探针的CYP2C19基因芯片,通过EDTA抗凝外周血样本提取基因组DNA,PCR扩增CYP2C19*2、*3突变片段并与芯片在43℃杂交,经洗涤、显色后扫描获取图像,经软件分析输出基因型并对基因芯片性能进行系统评价。
结果CYP2C19显色型基因芯片检出限为20 ng基因组DNA;与基因组DNA同等浓度鱼精DNA检测信号阴性;用*2/*2、*1/*3基因型样本重复检测10次,结果一致;常见浓度的甘油三酯、总胆固醇、胆红素和完全溶血对测定没有影响。临床三家医院临检实验室对1000例临床样本的检测与双向测序方法比对验证,结果一致。
结论为高通量基因诊断产品的产业化提供了一种实用的技术选择。
芯片分析技术;多态性,单核苷酸;基因分型技术;CYP2C19
基因芯片技术(即基因微阵列),是近年来发展起来的一种快速、高效核酸分析手段,美国FDA、中国CFDA均已批准基于基因芯片技术的基因诊断试剂上市,并广泛用于病源耐药基因筛查,疾病相关基因诊断和个体化用药基因诊断等[1-3]。但目前的基因芯片产品主要采用荧光检测原理,存在主要荧光标记原料被少数公司专利垄断,采用激光光源的荧光检测设备价格不菲,荧光信号易受光照等因素干扰导致重现性不佳,CV值偏大,检测后的芯片不能长期保存等不足,阻碍了该技术的产业化。
本研究旨在研究一种能克服上述不足的,基于显色原理的基因芯片技术,并用于CYP2C19基因多态性检测。……
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