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樱桃CBF基因的克隆及序列分析

2014-11-22张建朋陈新徐丽

山东农业科学 2014年10期
关键词:序列分析克隆樱桃

张建朋 陈新 徐丽 等

摘要:CBF(CRT/DRE-binding factor)基因是一种低温响应转录因子基因,CBF蛋白能够与很多低温相关基因的启动子结合,使其表达,从而增强植物抗冷能力。本研究利用已经公布的CBF序列的保守区设计特异引物,对樱桃砧木吉塞拉6号的cDNA进行扩增,成功获得CBF的全长序列。序列分析结果表明,其开放阅读框为723 bp,编码240个氨基酸,具有典型的AP2结构域及CBF特有的两段短肽序列。氨基酸序列同源性分析表明,该CBF与蔷薇科植物同源性较高,与其他科属植物同源性较差。

关键词:樱桃;CBF基因;克隆;序列分析

中图分类号:S662.503.4文献标识号:A文章编号:1001-4942(2014)10-0012-04

3结论

植物CBF/DREB类基因在非生物逆境响应

过程中具有重要功能。本研究成功克隆了樱桃砧木吉塞拉6号CBF基因的全长,并对其进行序列和遗传进化分析。该试验结果为进一步研究樱桃CBF基因的功能及冷诱导途径奠定了基础,也为该种樱桃的抗寒能力研究和抗冷系育种提供了理论依据。

参考文献:

[1]孔旭.中国果树栽培学[M]. 北京: 农业出版社,1987: 558-559.

[2]俞德浚.落叶果树分类学[M].上海:上海科学技术出版社,1984:114-125.

[3]于亚军,代汉萍,李宝江,等. 世界樱桃育种进展[J]. 果树学报,2003,20(2):135-139.

[4]王洋, 胡吉吉, 王崇英. 拟南芥CBF/DREB 途径的研究进展及其在植物基因工程中的应用[J]. 生物物理学报, 2007,23(2): 101-108.

[5]郭喜英,韦正乙,邢少辰,等.转录激活因子CBF与植物的抗胁迫能力[J].分子植物育种,2006,4(3):419-424.

[6]陈新,王贵禧,梁丽松,等. 平榛冷适应相关基因CBF的克隆及时空表达特性分析[J]. 林业科学,2012,48(1):167-172.

[7]张建朋,张士刚,陈新,等.麻核桃CBF基因的克隆与生物信息学分析[J].山东农业科学,2013,45(11):7-11.

[8]Champ K I,Febres V J,Moore B D. The role of CBF transcriptional activators in two Citrus species (Poncirus and Citrus) with contrasting levels of freezing tolerance[J]. Physiologia Plantarum,2007,129(3):529-541.

[9]Benedict C,Skinner J S,Meng R,et al. The CBF1-dependent low temperature signalling pathway,regulon and increase in freeze tolerance are conserved in Populus spp. [J]. Plant Cell Environ., 2006,29(7):1259-1272.

[10]Gilmour S J,Zarka D G,Stockinger E J,et al. Low temperature regulation of the Arabidopsis CBF family of AP2 transcriptional activators as an early step in cold-induced COR gene expression[J]. The Plant Journal,1998,16(4):433-442.

[11]Okamuo J K,Caster B,Villarroel R,et al. The AP2 domain of APETALA2 defines a large new family of DNA binding proteins in Arabidopsis[J]. Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 1997,94(13):7076-7081.

[12]李利斌,刘立锋,王殿峰,等.大白菜CBF4基因的克隆和遗传进化分析[J]. 山东农业科学,2009(4):1-4.

[13]Jaglo-Ottosen K R,Kleff S,Amundsen K L,et al. Components of the Arabidopsis C-repeat /dehydration -responsive element binding factor cold-response pathway are conserved in Brassica napus and other plant species[J]. Plant Physiology,2001,127(3):910-917.

摘要:CBF(CRT/DRE-binding factor)基因是一种低温响应转录因子基因,CBF蛋白能够与很多低温相关基因的启动子结合,使其表达,从而增强植物抗冷能力。本研究利用已经公布的CBF序列的保守区设计特异引物,对樱桃砧木吉塞拉6号的cDNA进行扩增,成功获得CBF的全长序列。序列分析结果表明,其开放阅读框为723 bp,编码240个氨基酸,具有典型的AP2结构域及CBF特有的两段短肽序列。氨基酸序列同源性分析表明,该CBF与蔷薇科植物同源性较高,与其他科属植物同源性较差。

关键词:樱桃;CBF基因;克隆;序列分析

中图分类号:S662.503.4文献标识号:A文章编号:1001-4942(2014)10-0012-04

3结论

植物CBF/DREB类基因在非生物逆境响应

过程中具有重要功能。本研究成功克隆了樱桃砧木吉塞拉6号CBF基因的全长,并对其进行序列和遗传进化分析。该试验结果为进一步研究樱桃CBF基因的功能及冷诱导途径奠定了基础,也为该种樱桃的抗寒能力研究和抗冷系育种提供了理论依据。

参考文献:

[1]孔旭.中国果树栽培学[M]. 北京: 农业出版社,1987: 558-559.

[2]俞德浚.落叶果树分类学[M].上海:上海科学技术出版社,1984:114-125.

[3]于亚军,代汉萍,李宝江,等. 世界樱桃育种进展[J]. 果树学报,2003,20(2):135-139.

[4]王洋, 胡吉吉, 王崇英. 拟南芥CBF/DREB 途径的研究进展及其在植物基因工程中的应用[J]. 生物物理学报, 2007,23(2): 101-108.

[5]郭喜英,韦正乙,邢少辰,等.转录激活因子CBF与植物的抗胁迫能力[J].分子植物育种,2006,4(3):419-424.

[6]陈新,王贵禧,梁丽松,等. 平榛冷适应相关基因CBF的克隆及时空表达特性分析[J]. 林业科学,2012,48(1):167-172.

[7]张建朋,张士刚,陈新,等.麻核桃CBF基因的克隆与生物信息学分析[J].山东农业科学,2013,45(11):7-11.

[8]Champ K I,Febres V J,Moore B D. The role of CBF transcriptional activators in two Citrus species (Poncirus and Citrus) with contrasting levels of freezing tolerance[J]. Physiologia Plantarum,2007,129(3):529-541.

[9]Benedict C,Skinner J S,Meng R,et al. The CBF1-dependent low temperature signalling pathway,regulon and increase in freeze tolerance are conserved in Populus spp. [J]. Plant Cell Environ., 2006,29(7):1259-1272.

[10]Gilmour S J,Zarka D G,Stockinger E J,et al. Low temperature regulation of the Arabidopsis CBF family of AP2 transcriptional activators as an early step in cold-induced COR gene expression[J]. The Plant Journal,1998,16(4):433-442.

[11]Okamuo J K,Caster B,Villarroel R,et al. The AP2 domain of APETALA2 defines a large new family of DNA binding proteins in Arabidopsis[J]. Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 1997,94(13):7076-7081.

[12]李利斌,刘立锋,王殿峰,等.大白菜CBF4基因的克隆和遗传进化分析[J]. 山东农业科学,2009(4):1-4.

[13]Jaglo-Ottosen K R,Kleff S,Amundsen K L,et al. Components of the Arabidopsis C-repeat /dehydration -responsive element binding factor cold-response pathway are conserved in Brassica napus and other plant species[J]. Plant Physiology,2001,127(3):910-917.

摘要:CBF(CRT/DRE-binding factor)基因是一种低温响应转录因子基因,CBF蛋白能够与很多低温相关基因的启动子结合,使其表达,从而增强植物抗冷能力。本研究利用已经公布的CBF序列的保守区设计特异引物,对樱桃砧木吉塞拉6号的cDNA进行扩增,成功获得CBF的全长序列。序列分析结果表明,其开放阅读框为723 bp,编码240个氨基酸,具有典型的AP2结构域及CBF特有的两段短肽序列。氨基酸序列同源性分析表明,该CBF与蔷薇科植物同源性较高,与其他科属植物同源性较差。

关键词:樱桃;CBF基因;克隆;序列分析

中图分类号:S662.503.4文献标识号:A文章编号:1001-4942(2014)10-0012-04

3结论

植物CBF/DREB类基因在非生物逆境响应

过程中具有重要功能。本研究成功克隆了樱桃砧木吉塞拉6号CBF基因的全长,并对其进行序列和遗传进化分析。该试验结果为进一步研究樱桃CBF基因的功能及冷诱导途径奠定了基础,也为该种樱桃的抗寒能力研究和抗冷系育种提供了理论依据。

参考文献:

[1]孔旭.中国果树栽培学[M]. 北京: 农业出版社,1987: 558-559.

[2]俞德浚.落叶果树分类学[M].上海:上海科学技术出版社,1984:114-125.

[3]于亚军,代汉萍,李宝江,等. 世界樱桃育种进展[J]. 果树学报,2003,20(2):135-139.

[4]王洋, 胡吉吉, 王崇英. 拟南芥CBF/DREB 途径的研究进展及其在植物基因工程中的应用[J]. 生物物理学报, 2007,23(2): 101-108.

[5]郭喜英,韦正乙,邢少辰,等.转录激活因子CBF与植物的抗胁迫能力[J].分子植物育种,2006,4(3):419-424.

[6]陈新,王贵禧,梁丽松,等. 平榛冷适应相关基因CBF的克隆及时空表达特性分析[J]. 林业科学,2012,48(1):167-172.

[7]张建朋,张士刚,陈新,等.麻核桃CBF基因的克隆与生物信息学分析[J].山东农业科学,2013,45(11):7-11.

[8]Champ K I,Febres V J,Moore B D. The role of CBF transcriptional activators in two Citrus species (Poncirus and Citrus) with contrasting levels of freezing tolerance[J]. Physiologia Plantarum,2007,129(3):529-541.

[9]Benedict C,Skinner J S,Meng R,et al. The CBF1-dependent low temperature signalling pathway,regulon and increase in freeze tolerance are conserved in Populus spp. [J]. Plant Cell Environ., 2006,29(7):1259-1272.

[10]Gilmour S J,Zarka D G,Stockinger E J,et al. Low temperature regulation of the Arabidopsis CBF family of AP2 transcriptional activators as an early step in cold-induced COR gene expression[J]. The Plant Journal,1998,16(4):433-442.

[11]Okamuo J K,Caster B,Villarroel R,et al. The AP2 domain of APETALA2 defines a large new family of DNA binding proteins in Arabidopsis[J]. Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 1997,94(13):7076-7081.

[12]李利斌,刘立锋,王殿峰,等.大白菜CBF4基因的克隆和遗传进化分析[J]. 山东农业科学,2009(4):1-4.

[13]Jaglo-Ottosen K R,Kleff S,Amundsen K L,et al. Components of the Arabidopsis C-repeat /dehydration -responsive element binding factor cold-response pathway are conserved in Brassica napus and other plant species[J]. Plant Physiology,2001,127(3):910-917.

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