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阿勒泰羊与新疆细毛羊ASIP基因多态性与被毛颜色的相关性

2014-09-02孟浩浩许瑞霞石国庆等

江苏农业科学 2014年7期
关键词:毛色

孟浩浩 许瑞霞 石国庆等

摘要:利用PCR-SSCP方法检测了阿勒泰羊和新疆细毛羊ASIP基因的多态性位点,并分析各 SNPs 位点与被毛毛色之间的关系。结果表明,阿勒泰羊ASIP基因外显子2(g.100~104 bp)存在 5 碱基丢失(D5:AGGAA),外显子4(g.5172 bp:T→A)存在非同义性突变(Ser→Cys);新疆细毛羊中只发现ASIP基因外显子 2(g.100~104 bp)存在 5 碱基丢失(D5:AGGAA);阿勒泰羊ASIP基因2处SNPs与被毛毛色不相关(P>0.05),而新疆细毛羊ASIP基因5碱基丢失与被毛毛色极显著相关(P<0.01)。

关键词:新疆细毛羊;阿勒泰羊;ASIP基因;SNPs;毛色;PCR-SSCP

中图分类号: S813.8;S826.2 文献标志码: A 文章编号:1002-1302(2014)07-0042-04

收稿日期:2013-10-14

基金项目:国家“863”计划(编号:2011AA100307-06);国家科技支撑计划(编号:2011BAD28B05-1);国家自然科学基金(编号:31001002、31360540)。

作者简介:孟浩浩(1988—),男,江苏丰县人,硕士研究生,主要从事绵羊毛色相关基因的筛选与鉴定研究。E-mail:576270343@qq.com。

通信作者:代蓉,副研究员,主要从事绵羊育种及养羊技术推广等工作。Tel:(0993)6683760;E-mail:dairong1@163.com。哺乳动物体内的色素分布广泛、种类多样,大量研究表明,黑色素细胞产生的酪氨酸源性色素(真黑素、褐黑素)是影响皮毛颜色的主要因素[1]。褐黑素为溶于碱的圆形红色颗粒,使皮肤、毛发表现为黄色、红色;真黑素比褐黑素难溶解,使皮肤和毛发表现为黑色、褐色[2]。动物表皮和毛囊中真黑色素、褐黑素的相对表达量最终决定了动物毛色。

ASIP是影响绵羊毛色的主要候选基因,在色素形成中起重要的调控作用[3]。它与α-促黑色素细胞激素(α-MSH)竞争结合黑素皮质激素受体1(melanocortin-1,MC1R),使MC1R结构改变,抑制环磷酸腺苷(cAMP)酶系统,引起cAMP 水平下降,通过级联反应,促进褐黑素的产生[4-5]。ASIP基因在绵羊基因组中存在多个拷贝和等位基因[6],编码的鼠灰信号蛋白由133个氨基酸残基组成。在研究藏羊、哈尔达绵羊等品种时发现,ASIP基因与绵羊的毛色相关。人、马、牛、羊驼、兔、狗等物种ASIP基因多态性位点与毛色和肤色之间关系的研究已有大量报道,研究发现突变位点与毛色相关,但目前尚未深入探讨细毛羊该基因与毛色形成的关系。因为细毛羊经长期选育均为白色个体,由于生物多样性和种质特性的关系,其他绵羊、山羊的研究结果并不能完全反映新疆细毛羊中该基因的特点。笔者长期从事优质细毛羊的选育研究,在实际生产中发现了自然突变的黑色细毛羊个体,这为开展ASIP基因与细毛羊毛色形成的关系提供了极好的试验样本。本研究以新疆细毛羊及阿勒泰羊为模型,探究 ASIP 基因SNPs 位点与绵羊毛色的关系,以期为探明绵羊毛色形成的调控机制奠定基础。

1材料与方法

1.1样本采集及 DNA 提取

采集新疆农垦科学院试验羊场成年阿勒泰羊(黄色、白色各 1 只,黑色 11 只,棕色 96 只)及新疆细毛羊(棕色5只,白色60只)耳缘组织(图1),利用酚-氯仿法提取组织DNA,经琼脂糖凝胶电泳和分光光度计检测的合格样品放于-20 ℃保存备用。

1.2主要试剂

蛋白酶K、无水乙醇、Tris-饱和酚、氯仿、常规PCR试剂(TaKaRa),琼脂糖、丙烯酰胺、甲叉双丙烯酰胺(Sigma公司),DL 100 bp Marker(天根 Code:DM109),变性加样缓冲液[甲酰胺98%、10 mmol/L EDTA(pH值 8.0)、 0.25%溴酚蓝、 0.25%二甲苯青]、琼脂糖凝胶回收试剂盒(天根 Code:DP209)。

1.3引物设计

根据GenBank 数据库中绵羊 ASIP基因(Genbank 登录号:EU420022)设计引物(表 1),这3对引物分别位于ASIP基因的外显子 2、3、4上,引物由 Invitrogen 公司合成。

1.4ASIP基因核苷酸多态性分析

2.4ASIP各基因型频率与基因频率

从表3、表4可知,本研究中检测到阿勒泰羊、新疆细毛羊外显子2有2种基因型(N5N5、N5D5),在阿勒泰羊中N5N5基因型频率较高,而新疆细毛羊中结果恰好相反。经卡方检验发现,该基因型与阿勒泰羊毛色不存在相关性(P>0.05),但与新疆细毛羊毛色显著相关(P<0.01)。外显子4中检测到2种基因型(AB、BB),经卡方检验发现,该位点基因型与2种绵羊的毛色不相关(P>0.05)。

3结论与讨论

阿勒泰羊毛色以棕红色或淡棕色为主,纯黑、纯白、纯黄的阿勒泰羊不多[7];新疆细毛羊以白色为主,黑色或其他毛色的新疆细毛羊稀少。在本研究样品中,棕色阿勒泰羊和白色新疆细毛羊占多数,纯黑、纯白、纯黄的阿勒泰羊及棕色细毛羊个体数较少。为使研究结果更为直观,本研究没有采集头部、四肢与身体毛色相异的阿勒泰羊组织样。

ASIP是影响绵羊毛色的主要候选基因,在绵羊基因组中存在多个拷贝和等位基因[6]。ASIP 编码的鼠灰信号蛋白由133个氨基酸残基组成,在不同品种绵羊中 SNPs 位点存在差异:藏羊的ASIP基因外显子 2 只存在 5 bp(g.100~104 bp:AGGAG)的丢失[8];澳大利亚美利奴绵羊[6]、哈萨克羊[9]外显子 2 既存在 5 bp(g.100~104 bp:AGGAG)丢失,又存在 9 bp(g.10~19 bp:AGCCGCCTC)丢失。研究表明,美利奴羊的显性白色受 ASIP基因、AHCY 编码区及 ITCH 启动子区域的影响,多拷贝的ASIP基因编码区受临近的多个ITCH启动子调控,导致显性白色表型[6];有关藏羊毛色与ASIP基因拷贝数的研究表明,藏羊纯白与纯黑表型与ASIP基因拷贝数不相关[8]。本研究结果与以往对藏羊[8]、美利奴羊[6]、哈萨克羊[9]的研究结果一致:ASIP基因外显子 3中没有发现 SNPs位点。阿勒泰羊ASIP基因外显子 2 存在 5 bp(g.100~104 bp:AGGAG)丢失,这与已往研究结果相同。但在供试阿勒泰羊、新疆细毛羊样品中没有发现该品种绵羊存在 9 bp丢失,可能是由于部分毛色表型的羊个体数较少,致使其没有被检测到,可通过扩大样品量再筛查。

参考文献:

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