极地抗植物病原真菌活性菌株PKS和NRPS基因的克隆与分析*1
2014-08-25彭玉娇李敬龙林学政
彭玉娇,李敬龙,林学政
(1. 齐鲁工业大学 食品与生物工程学院,山东 济南 250353; 2. 国家海洋局 第一海洋研究所,山东 青岛 266061; 3.国家海洋局 海洋生物活性物质重点实验室,山东 青岛 266061)
极地抗植物病原真菌活性菌株PKS和NRPS基因的克隆与分析*1
彭玉娇1,2,3,李敬龙1,林学政2,3*
(1. 齐鲁工业大学 食品与生物工程学院,山东 济南 250353; 2. 国家海洋局 第一海洋研究所,山东 青岛 266061; 3.国家海洋局 海洋生物活性物质重点实验室,山东 青岛 266061)
植物常见病原真菌尖孢镰刀菌(Fusariumoxysporum)为指示菌,采用平板扩散法对实验室保藏的38株极地细菌进行了抑菌活性验证,并对其中活性较强的菌株进行了分子鉴定与系统发育分析及次级代谢产物合成功能基因(PKS和NRPS)的克隆与分析。结果表明,38株极地细菌中,13株具有明显的抗病原真菌活性;分子鉴定与系统发育分析表明,11株活性菌株属于Pseudomonas,1株属于Psychrobacter,1株属于Arthrobacter;对活性菌株PKS和NRPS基因的克隆与分析表明,从10株活性菌株克隆到12条NRPS A结构域基因片段,其中5株活性菌株同时含有PKS I型 KS结构域基因片段。据此为从聚酮和非核糖体肽等生物合成途径深入研究活性菌株的次级代谢产物提供了基因学证据。
极地细菌;抑菌活性;多聚酮合酶;非核糖体肽合成酶
微生物来源的天然产物一直是发现新型药物先导化合物的重要来源。经过长期和广泛深入的研究之后,从陆地微生物中发现新的天然产物已越来越困难,而蕴涵着极其丰富生物资源的海洋微生物种群则是当今天然产物药物开发的巨大宝库。……
