樊路娟，张春霞，徐庆刚，张驰宇

（1.江苏大学生命科学研究院，江苏镇江212013；2.中国科学院上海巴斯德研究所，上海200025）

罗氏HIV-1定量检测引物SK145和SKCC1B的评估及优化

樊路娟1，2，张春霞1，徐庆刚1，张驰宇1，2

（1.江苏大学生命科学研究院，江苏镇江212013；2.中国科学院上海巴斯德研究所，上海200025）

目的：评估罗氏HIV-1检测系统中引物SK145和SKCC1B对不同亚型HIV-1病毒定量检测的广谱性及准确性，并在此基础上对该引物进行优化。方法：下载并分析5个主要HIV-1流行亚型（B、C、A、01＿AE、D）在引物SK145和SKCC1B扩增区段的对应序列，从各亚型筛选出所占比例最高的5条序列构建定量标准品。用梯度稀释的HIV-1各亚型标准品来评估引物SK145和SKCC1B的扩增效率。为改善引物SK145和SKCC1B对HIV-1不同亚型扩增的准确性和广谱性，我们重新设计了一对简并引物并分析其对不同亚型病毒的扩增效果。结果：引物SK145、SKCC1B对于B亚型病毒的扩增效果最好，而对非B亚型病毒的扩增效果并不理想，简并引物能显著改善对各亚型HIV-1病毒扩增的效果。结论：罗氏引物SK145和SKCC1B不适用于非B亚型HIV-1病毒载量的定量检测，而优化设计的简并引物能改善对各亚型HIV-1病毒的扩增效率，因而可用于中国等HIV-1多亚型共流行国家的HIV-1病毒载量检测。

人类免疫缺陷病毒1型；实时荧光定量PCR；SK145；SKCC1B

人类免疫缺陷病毒1型（human immunodeficiency virus type 1，HIV-1）是导致全球艾滋病（acquired immunodeficiency syndrome，AIDS）流行的主要病原体。HIV-1的遗传异质性是影响病毒载量定量可靠性的一个重要因素，而所有的核酸扩增或信号扩增技术都依赖于HIV-1序列特异性的引物和（或）探针，引物（探针）结合区的核苷酸不匹配会干扰杂交从而影响定量结果的可靠性。……