张 琪，刘立芳，马 磊，贺建峰

昆明理工大学 信息工程与自动化学院，昆明 650500

一种基于HBV序列的SNP位点检测方法研究

张 琪，刘立芳，马 磊，贺建峰

昆明理工大学 信息工程与自动化学院，昆明 650500

1 介绍

乙型肝炎病毒属于被称为肝脱氧核糖核酸病毒科的病毒族，严重影响人类健康，它与DNA病毒关系密切。这种类型的病毒感染是一种严重的全球健康问题，也是常见的诱发肝脏疾病和肝癌的原因。据估计，全球至少有20亿人感染乙肝病毒，多达3.78亿人患有慢性感染，每年大约有62万人死于由HBV感染引发的急性和慢性病[1-2]。此外，每年全世界新增450万HBV感染病例，其中四分之一发展成为肝脏类疾病[3]。

HBV是一种环状的非闭合双链DNA分子，全基因长约为3.2 bp。乙型肝炎病毒可编码四个重叠的开放阅读框（ORFs：S，C，P和X）。S ORF编码乙型肝炎表面抗原（HBsAg），它在结构上和功能上分为pre-S1，pre-S2，和S区，C ORF编码乙肝e抗原和核蛋白，P ORF编码聚合酶蛋白，X ORF编码X蛋白[4]。HBV根据基因组序列之间差异性大于8%的基因分型标准进行分型[5-8]。并且其基因型在不同的地区流行程度或分布不同。

在物种遗传进化过程中，变异是各种生物对“适者生存”原则的生动体现。HBV病毒为了达到在宿主体内长期生存和传播的目的，也必然具有这种内在的潜力。研究表明HBV基因变异可能导致每个HBV患者受HBV感染后，其病情轻重存在很大差异，给乙肝的治疗和诊断带来了许多问题。然而目前却没有很好的药物及方法对其进行有效的治疗。目前国际上采用的接种疫苗的方法，几乎成了唯一的预防措施，并取得了较好的成效，使得HBsAg携带者显著减少。……