APP下载

紫锥菊遗传多样性的SRAP分析

2014-07-18韩琳娜

山东农业科学 2014年5期
关键词:遗传多样性

摘要:采用SRAP分子标记技术,对14份引种紫锥菊材料的遗传多样性进行分析。结果显示,9对SRAP引物组合扩增出171条带,多态性比率为80.7%,说明SRAP可应用于紫锥菊种内遗传多样性分析;聚类分析表明紫锥菊样品间的亲缘关系与种质来源地存在一定的相关性。

关键词:紫锥菊;SRAP;遗传多样性

中图分类号:S567.9文献标识号:A文章编号:1001-4942(2014)05-0060-03

紫锥菊[Echinacea purpurea (L.) Moench]为菊科松果菊属植物,原产北美洲,具有广泛的治疗范围和稳定确切的疗效[1~3],近年来成为国际草药市场十大流行草药之一。20世纪90年代,国内各地开始作为药用植物引种。不同种源紫锥菊在株高、茎色、花色及有效成分含量等方面均有一定差异,呈现出一定的遗传多样性。笔者曾利用过氧化物同工酶对紫锥菊的遗传多样性进行初步研究[4]。DNA多态性是生物多样性的本质,越接近DNA水平的数据就越能准确反映植物的遗传多样性。SRAP技术作为新近开发出的分子标记技术,已在部分药用植物研究中应用[5~7],但在紫锥菊中的研究尚未见报道。本试验利用SRAP分子标记技术研究紫锥菊的遗传多样性,构建系统进化树,为合理开发和利用药用紫锥菊资源奠定基础。

1材料与方法

1.1试验材料

以茎色、花色和舌状花瓣形态作为主要形态学鉴定指标,选择表型差异明显的14个样品作为试验材料,于2010年7月采自安徽桐城和山东中医药大学药用植物园(表1)。经山东中医药大学教授周凤琴鉴定为紫锥菊[Echinacea purpurea(L.)Moench]。取各样品植株嫩叶,硅胶干燥,保存备用。

1.2试验方法

1.2.1基因组DNA的提取供试材料基因组DNA的提取采用改良CTAB法[8]。

2.3聚类分析

SRAP分子标记技术针对基因的外显子GC含量丰富而启动子和内含子AT丰富的特点设计引物进行扩增[7],检测基因的可读框区域,因而体现的是物种间基因的多态性。由图2可知,在遗传相似系数为0.70时,14份供试样品分为5个类群。同引种自浙江的Z3、Z9和Z10聚合在一起,L单独聚为一类,表明紫锥菊样品间的亲缘关系与种质来源地之间存在一定相关性。

3结论与讨论

由于多态性条带比率计算简单、直观且能够在一定程度上反映遗传多样性,因此在研究中得到广泛应用。本研究用筛选出的9对SRAP引物组合对14份不同地域不同表型的紫锥菊样品进行PCR扩增,多态性条带百分率为80.7%。表明SRAP可以应用于紫锥菊种内遗传多样性分析。同时也说明,不同地域来源或不同表型的紫锥菊样品材料间有着丰富的遗传多样性,存在较大的遗传差异。从遗传学的角度来看,丰富的遗传多样性意味着较高的适应能力、较大的进化潜力以及丰富的育种和遗传改良潜力。14份紫锥菊样品间的遗传相似系数为0.6140~0.8129,聚类结果显示,来源地相同的样品聚为一类,说明紫锥菊样品间的亲缘关系与种质来源地之间存在一定相关性。

参考文献:

[1]岑国栋,雒蓬轶,高永翔.紫锥菊药理作用研究进展[J].现代药物与临床,2010,25(1):15-18.

[2]胡海建.引种紫锥菊中咖啡酸衍生物标准化研究[D].青岛:中国海洋大学,2011.

[3]陈荣,杨跃生,吴鸿.不同采收期紫锥菊产量及菊苣酸动态变化研究[J].中草药,2012,43(6):1186-1190.

[4]韩琳娜,周凤琴.不同种源引种紫锥菊的过氧化物酶同工酶分析[J].四川农业大学学报,2011,29(1):52-55.

[5]李廷春,樊洪泓,高正良, 等.丹参遗传多样性的SRAP标记分析[J].核农学报,2008,22(5):576-580.

[6]樊洪泓,李廷春,邱婧, 等.药用石斛遗传多样性的SRAP标记研究[J].2008, 33(1):6-10.

[7]郑海燕.利用RAPD、ISSR和SRAP标记技术构建红麻(Hibiscus cannabinus L.)种质资源分子身份证[D].北京:中国农业科学院,2010.

[8]王婷,李爱贤,郭庆梅,等.忍冬叶片基因组DNA的提取与分析[J].山东中医药大学学报,2008,32(3):247-249.

[9]Li G, Quiros C F. Sequence-related amplified polymorphism (SRAP), a new marker system based on a simple PCR reaction: Its application to mapping and gene tagging in Brassica[J]. Theoretical and Applied Genetics, 2001, 103(2/3):455-461.山 东 农 业 科 学2014,46(5):63~65Shandong Agricultural Sciences山 东 农 业 科 学第46卷第5期陈宝芳,等endprint

摘要:采用SRAP分子标记技术,对14份引种紫锥菊材料的遗传多样性进行分析。结果显示,9对SRAP引物组合扩增出171条带,多态性比率为80.7%,说明SRAP可应用于紫锥菊种内遗传多样性分析;聚类分析表明紫锥菊样品间的亲缘关系与种质来源地存在一定的相关性。

关键词:紫锥菊;SRAP;遗传多样性

中图分类号:S567.9文献标识号:A文章编号:1001-4942(2014)05-0060-03

紫锥菊[Echinacea purpurea (L.) Moench]为菊科松果菊属植物,原产北美洲,具有广泛的治疗范围和稳定确切的疗效[1~3],近年来成为国际草药市场十大流行草药之一。20世纪90年代,国内各地开始作为药用植物引种。不同种源紫锥菊在株高、茎色、花色及有效成分含量等方面均有一定差异,呈现出一定的遗传多样性。笔者曾利用过氧化物同工酶对紫锥菊的遗传多样性进行初步研究[4]。DNA多态性是生物多样性的本质,越接近DNA水平的数据就越能准确反映植物的遗传多样性。SRAP技术作为新近开发出的分子标记技术,已在部分药用植物研究中应用[5~7],但在紫锥菊中的研究尚未见报道。本试验利用SRAP分子标记技术研究紫锥菊的遗传多样性,构建系统进化树,为合理开发和利用药用紫锥菊资源奠定基础。

1材料与方法

1.1试验材料

以茎色、花色和舌状花瓣形态作为主要形态学鉴定指标,选择表型差异明显的14个样品作为试验材料,于2010年7月采自安徽桐城和山东中医药大学药用植物园(表1)。经山东中医药大学教授周凤琴鉴定为紫锥菊[Echinacea purpurea(L.)Moench]。取各样品植株嫩叶,硅胶干燥,保存备用。

1.2试验方法

1.2.1基因组DNA的提取供试材料基因组DNA的提取采用改良CTAB法[8]。

2.3聚类分析

SRAP分子标记技术针对基因的外显子GC含量丰富而启动子和内含子AT丰富的特点设计引物进行扩增[7],检测基因的可读框区域,因而体现的是物种间基因的多态性。由图2可知,在遗传相似系数为0.70时,14份供试样品分为5个类群。同引种自浙江的Z3、Z9和Z10聚合在一起,L单独聚为一类,表明紫锥菊样品间的亲缘关系与种质来源地之间存在一定相关性。

3结论与讨论

由于多态性条带比率计算简单、直观且能够在一定程度上反映遗传多样性,因此在研究中得到广泛应用。本研究用筛选出的9对SRAP引物组合对14份不同地域不同表型的紫锥菊样品进行PCR扩增,多态性条带百分率为80.7%。表明SRAP可以应用于紫锥菊种内遗传多样性分析。同时也说明,不同地域来源或不同表型的紫锥菊样品材料间有着丰富的遗传多样性,存在较大的遗传差异。从遗传学的角度来看,丰富的遗传多样性意味着较高的适应能力、较大的进化潜力以及丰富的育种和遗传改良潜力。14份紫锥菊样品间的遗传相似系数为0.6140~0.8129,聚类结果显示,来源地相同的样品聚为一类,说明紫锥菊样品间的亲缘关系与种质来源地之间存在一定相关性。

参考文献:

[1]岑国栋,雒蓬轶,高永翔.紫锥菊药理作用研究进展[J].现代药物与临床,2010,25(1):15-18.

[2]胡海建.引种紫锥菊中咖啡酸衍生物标准化研究[D].青岛:中国海洋大学,2011.

[3]陈荣,杨跃生,吴鸿.不同采收期紫锥菊产量及菊苣酸动态变化研究[J].中草药,2012,43(6):1186-1190.

[4]韩琳娜,周凤琴.不同种源引种紫锥菊的过氧化物酶同工酶分析[J].四川农业大学学报,2011,29(1):52-55.

[5]李廷春,樊洪泓,高正良, 等.丹参遗传多样性的SRAP标记分析[J].核农学报,2008,22(5):576-580.

[6]樊洪泓,李廷春,邱婧, 等.药用石斛遗传多样性的SRAP标记研究[J].2008, 33(1):6-10.

[7]郑海燕.利用RAPD、ISSR和SRAP标记技术构建红麻(Hibiscus cannabinus L.)种质资源分子身份证[D].北京:中国农业科学院,2010.

[8]王婷,李爱贤,郭庆梅,等.忍冬叶片基因组DNA的提取与分析[J].山东中医药大学学报,2008,32(3):247-249.

[9]Li G, Quiros C F. Sequence-related amplified polymorphism (SRAP), a new marker system based on a simple PCR reaction: Its application to mapping and gene tagging in Brassica[J]. Theoretical and Applied Genetics, 2001, 103(2/3):455-461.山 东 农 业 科 学2014,46(5):63~65Shandong Agricultural Sciences山 东 农 业 科 学第46卷第5期陈宝芳,等endprint

摘要:采用SRAP分子标记技术,对14份引种紫锥菊材料的遗传多样性进行分析。结果显示,9对SRAP引物组合扩增出171条带,多态性比率为80.7%,说明SRAP可应用于紫锥菊种内遗传多样性分析;聚类分析表明紫锥菊样品间的亲缘关系与种质来源地存在一定的相关性。

关键词:紫锥菊;SRAP;遗传多样性

中图分类号:S567.9文献标识号:A文章编号:1001-4942(2014)05-0060-03

紫锥菊[Echinacea purpurea (L.) Moench]为菊科松果菊属植物,原产北美洲,具有广泛的治疗范围和稳定确切的疗效[1~3],近年来成为国际草药市场十大流行草药之一。20世纪90年代,国内各地开始作为药用植物引种。不同种源紫锥菊在株高、茎色、花色及有效成分含量等方面均有一定差异,呈现出一定的遗传多样性。笔者曾利用过氧化物同工酶对紫锥菊的遗传多样性进行初步研究[4]。DNA多态性是生物多样性的本质,越接近DNA水平的数据就越能准确反映植物的遗传多样性。SRAP技术作为新近开发出的分子标记技术,已在部分药用植物研究中应用[5~7],但在紫锥菊中的研究尚未见报道。本试验利用SRAP分子标记技术研究紫锥菊的遗传多样性,构建系统进化树,为合理开发和利用药用紫锥菊资源奠定基础。

1材料与方法

1.1试验材料

以茎色、花色和舌状花瓣形态作为主要形态学鉴定指标,选择表型差异明显的14个样品作为试验材料,于2010年7月采自安徽桐城和山东中医药大学药用植物园(表1)。经山东中医药大学教授周凤琴鉴定为紫锥菊[Echinacea purpurea(L.)Moench]。取各样品植株嫩叶,硅胶干燥,保存备用。

1.2试验方法

1.2.1基因组DNA的提取供试材料基因组DNA的提取采用改良CTAB法[8]。

2.3聚类分析

SRAP分子标记技术针对基因的外显子GC含量丰富而启动子和内含子AT丰富的特点设计引物进行扩增[7],检测基因的可读框区域,因而体现的是物种间基因的多态性。由图2可知,在遗传相似系数为0.70时,14份供试样品分为5个类群。同引种自浙江的Z3、Z9和Z10聚合在一起,L单独聚为一类,表明紫锥菊样品间的亲缘关系与种质来源地之间存在一定相关性。

3结论与讨论

由于多态性条带比率计算简单、直观且能够在一定程度上反映遗传多样性,因此在研究中得到广泛应用。本研究用筛选出的9对SRAP引物组合对14份不同地域不同表型的紫锥菊样品进行PCR扩增,多态性条带百分率为80.7%。表明SRAP可以应用于紫锥菊种内遗传多样性分析。同时也说明,不同地域来源或不同表型的紫锥菊样品材料间有着丰富的遗传多样性,存在较大的遗传差异。从遗传学的角度来看,丰富的遗传多样性意味着较高的适应能力、较大的进化潜力以及丰富的育种和遗传改良潜力。14份紫锥菊样品间的遗传相似系数为0.6140~0.8129,聚类结果显示,来源地相同的样品聚为一类,说明紫锥菊样品间的亲缘关系与种质来源地之间存在一定相关性。

参考文献:

[1]岑国栋,雒蓬轶,高永翔.紫锥菊药理作用研究进展[J].现代药物与临床,2010,25(1):15-18.

[2]胡海建.引种紫锥菊中咖啡酸衍生物标准化研究[D].青岛:中国海洋大学,2011.

[3]陈荣,杨跃生,吴鸿.不同采收期紫锥菊产量及菊苣酸动态变化研究[J].中草药,2012,43(6):1186-1190.

[4]韩琳娜,周凤琴.不同种源引种紫锥菊的过氧化物酶同工酶分析[J].四川农业大学学报,2011,29(1):52-55.

[5]李廷春,樊洪泓,高正良, 等.丹参遗传多样性的SRAP标记分析[J].核农学报,2008,22(5):576-580.

[6]樊洪泓,李廷春,邱婧, 等.药用石斛遗传多样性的SRAP标记研究[J].2008, 33(1):6-10.

[7]郑海燕.利用RAPD、ISSR和SRAP标记技术构建红麻(Hibiscus cannabinus L.)种质资源分子身份证[D].北京:中国农业科学院,2010.

[8]王婷,李爱贤,郭庆梅,等.忍冬叶片基因组DNA的提取与分析[J].山东中医药大学学报,2008,32(3):247-249.

[9]Li G, Quiros C F. Sequence-related amplified polymorphism (SRAP), a new marker system based on a simple PCR reaction: Its application to mapping and gene tagging in Brassica[J]. Theoretical and Applied Genetics, 2001, 103(2/3):455-461.山 东 农 业 科 学2014,46(5):63~65Shandong Agricultural Sciences山 东 农 业 科 学第46卷第5期陈宝芳,等endprint

猜你喜欢

遗传多样性
福州地区柑橘种质资源的ISSR分析
应用RAPD分析方法评估春黑麦品种的遗传多样性
攀枝花芒果遗传多样性的RAPD分析
鸢尾属部分种质资源遗传多样性的SRAP分析
西藏冬青稞种质资源SNP标记的遗传多样性分析
胶东地区金银花品种间遗传关系的RAPD分析
基于SRAP标记的湘产百合核心种质库构建
马尾松种质资源遗传多样性的ISSR分析
基于SRAP分子标记的黄颡鱼属遗传多样性分析
冀中南地区16个平菇栽培菌株的ISSR分析