长链非编码RNAs与妇科肿瘤
2014-03-21赵文钺刘福囡
刘 璐,赵文钺,刘福囡
(1.中国医科大学,辽宁 沈阳 110001;2.中国医科大学第一附属医院肿瘤外科,辽宁 沈阳 110001)
1 长链非编码RNA
随着深度测序和去基因组高密度“覆瓦式”等高通量测序技术的快速发展,研究者发现人类基因组中有成千上万的RNA进行转录,其中只有1.5%具有编码蛋白质的功能,非编码RNAs(ncRNAs)的数量超过编码蛋白质基因数量的好多倍[1-3]。其中ncRNAs又分为微小 RNAs(22~23 nts,microRNAs)和长链非编码 RNAs(>200 nts,lncRNAs)[4]。
目前,对lncRNA最常使用的定义是:长度大于200个核酸,且不翻译蛋白质的RNA。但这个定义过于简单,而且没有考虑到某些问题。首先,规定为200个核酸是被随意选择的,且多数是在RNA纯化期间RNA结合在硅胶柱上为基础定义的,而不是从其功能意义上解释的[5]。其次,一个PCG总是被定义为转录本,包含多于100个氨基酸的开放阅读框(opening reading frame,ORF)[6]。但是,lncRNAs可以包含长于100个氨基酸的ORFs,而且它们不一定合成多肽;另外,少于100个氨基酸的多肽在生物体中会发挥功能,它们并不是蛋白质的典型副产物[7]。最后,同样的RNA可以同时包含PCGs功能和非编码功能[8-10]。这些事实都表明目前人类对ncRNAs了解甚少,可见定义它非常困难。
因此,基于以上问题[11],对 lncRNAs提出了新的定义:有原始或是剪切转录本功能的RNA,并不符合miRNAs、piRNAs和snoRNAs等小分子RNAs的已知定义,或是不属于结构RNAs的范畴(例如,转移 RNA、核仁小分子 RNAs和剪切RNA)。这种定义的优势就在于缺乏ORFs限制的情况下,指出RNA分子既可以具有编码功能,也可以具有非编码功能,而且可以在随意的位置存在长度缺失。
大多数的RNA转录本除了为蛋白质的合成提供模版外,还执行着许多不同的功能,如:控制胚胎发育、分化、印记、X染色体失活、免疫反应、应激反应。……
