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MYCT1新转录本的克隆与表达分析

2014-03-21符爽孙开来富伟能

中国医科大学学报 2014年5期
关键词:方法

符爽,孙开来,富伟能

(中国医科大学1.基础医学院遗传学教研室,沈阳110001;2.附属盛京医院血液研究室,沈阳110022)

MYCT1新转录本的克隆与表达分析

符爽1,2,孙开来1,富伟能1

(中国医科大学1.基础医学院遗传学教研室,沈阳110001;2.附属盛京医院血液研究室,沈阳110022)

目的确定MYCT1基因的转录起始点并克隆该基因新的转录本,探讨该基因的结构和功能。方法利用已知MYCT1的保守序列,应用5′-RACE技术确定转录起始点位置,结合3′-RACE拼接得到新转录本的精确全长;然后利用生物信息学软件对新转录本与MYCT1的cDNA序列及氨基酸序列进行对比分析;最后利用RT-PCR的方法分析新转录本的细胞表达谱。结果成功克隆得到长1 106 bp的新转录本MYCT1-TV,其转录起始点位于ATG上游140 bp处。MYCT1-TV与MYCT1在结构上无明显差异,并广泛表达于各个细胞系。结论MYCT1转录起始点的确定和新转录本MYCT1-TV的克隆,为进一步研究MYCT1基因的转录调控机制及基因功能奠定了实验基础。

MYCT1;MYCT1-TV;喉癌;RACE

MYCT1(Myc target 1)是本研究室前期应用实体瘤培养、常规G显带、FISH及电子杂交的方法从喉鳞状细胞癌(laryngeal squamous cell carcinoma,LSCC,以下简称喉癌)中克隆得到的新基因,曾命名MTLC(c-Myc target from laryngeal cancer cells),Gen-Bank登录号为AF_527367[1]。

MYCT1基因定位于染色体6q25,全长约21 kb,含2个外显子,其mRNA序列长约1 006 bp,编码含235个氨基酸的蛋白质。本研究组在前期研究中通过生物信息学方法,预测该基因转录起始点位于ATG上游47 bp处[1],但未经实验证实。进一步研究MYCT1基因的结构并确定其转录起始点,对了解该基因的功能和阐明其转录调控机制具有重要意义。本研究利用已知MYCT1的保守序列,以正常人外周血……

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