鸭茅品种的SCoT遗传变异分析
2014-01-02蒋林峰张新全黄琳凯马啸严德飞胡强付玉凤
蒋林峰,张新全 ,黄琳凯,马啸,严德飞,胡强,付玉凤
(1.四川农业大学动物科技学院草业科学系,四川雅安625014;2.重庆市垫江县畜牧生产站,重庆408300)
目标起始密码子多态性(start codon targeted polymorphism,SCoT),是基于SRAP(sequence-related amplified polymorphism,相关扩增多态性)[1]的一种新型目的基因分子标记技术,其产生的显性多态性偏向候选功能基因区[2]。主要依据植物基因中ATG翻译起始位点侧翼序列的保守性而设计[3-4]。另外,较高退火温度的设计有助于减少假阳性扩增的可能性[5]。与其他标记相比,SCoT标记结合了ISSR(inter simple sequence repeat,简单重复序列间区)[6-7]和RAPD(randomly amplified polymorphic DNA,随机扩增多态性DNA)的优点,具引物通用性,稳定性好,重复性好等优点,同时能有效产生相关性状多态,更好地反映物种遗传多样性和亲缘关系[8]。自2009年开发以来,已有其用于葡萄(Vitis vinifera)[9]、芒果(Mangifera indica)[10]、花生(Arachis hypogaea)[11]、土豆(Solanum tuberosum)[12]等农作物和植物的相关研究报道。但就牧草研究领域,目前仅有SCoT标记用于苜蓿(Medicago sativa)[4]种质遗传分析的少量报道。
鸭茅(Dactylis glomerata)为禾本科(Poaceae)早熟禾亚科(Pooideae)鸭茅属(Dactylis)多年生疏丛型禾草[13-14],是鸭茅亚种中重要的同源四倍体栽培种[15],起源于欧洲、北非和亚洲温带地区[16],因草质柔嫩、叶量丰富、耐荫性强、适口性好等优点,在世界各地被广泛应用于饲草栽培和干草制作[17],是温带和亚热带地区重要优良牧草。我国是鸭茅起源地之一,已发现野生鸭茅生长地约26个[18],可分为二倍体(2n=2x=14)、四倍体(2n=4x=28)及稀有的六倍体(2n=6x=42)3种类型[19],近年来,鸭茅大量应用于我国草地畜牧业及生态建设,取得了良好的经济和生态效益。
到目前,我国审定登记鸭茅品种仅为8个,且只有“宝兴”、“川东”、“古蔺”3个品种通过野生栽培驯化而来,其余5个皆为引进品种,国内鸭茅品种遗传基础相对狭窄,引进品种普遍表现出在当地抗性低、适应性差等缺点,难以满足我国生态治理和畜牧业发展的需求。……
