APP下载

CARP1基因克隆、表达及其泛素连接酶活性的鉴定

2013-10-29张睿苏文莉孙走南杨益刘京梅何湘

生物技术通讯 2013年1期
关键词:泛素缓冲液结构域

张睿 ,苏文莉 ,孙走南 ,杨益 ,刘京梅 ,何湘

1.辽宁省肿瘤医院,辽宁 沈阳 110042;2.军事医学科学院 疾病预防控制所,北京 100071

大肠癌是最常见的恶性肿瘤之一,其发病率呈逐年增加的趋势。研究大肠癌的发生机制,有助于肿瘤的早期诊断、治疗。我们在前期工作中发现,与癌旁组织相比,结肠癌患者组织标本中caspase 8/10相关RING结构域蛋白1(caspase-8/10-associated RING domain protein1,CARP1)基因表达量显著增高。因此,为了更进一步研究CARP1在不同信号通路的功能,我们克隆了CARP1的全长基因,并构建了其真核表达载体,在293T细胞中进行了瞬时转染,发现表达的CARP1具有相应的生物学功能,为下一步研究奠定了工作基础。

1 材料和方法

1.1 材料

293T细胞、HCT116细胞、大肠杆菌DH5α、真核表达载体pcDNA3-Flag、受体相互作用蛋白1(recep⁃tor-interacting protein 1,RIP1)表 达 质 粒 Flag-RIP1、泛素表达质粒HA-Ubi由本实验室保存;限制性内切酶BamHⅠ、XhoⅠ和cDNA合成试剂盒购自TaKaRa公司;T4DNA快速连接酶购自全氏金公司;蛋白酶体抑制剂MG132购自Sigma公司;萤光素酶活性测定试剂盒购自Promega公司;转染试剂Vigo⁃fect购自威格拉斯公司;DMEM培养基购自GIBCO生物公司;胎牛血清为杭州四季青公司产品;Flag抗体购自Sigma公司;辣根过氧化物酶(HRP)标记的羊抗鼠IgG购自中杉金桥生物有限公司;胶内DNA回收试剂盒、大量质粒提取试剂盒、TRIzol试剂和Pfu DNA聚合酶Mix购自北京天根生化科技有限公司;引物合成和测序由奥科公司完成。

1.2 从结肠癌细胞中扩增CARP1基因

参考TRIzol使用说明,从HCT116细胞中提取总RNA。根据CARP1的基因序列(GenBank登录号:NM_025126.2)和pcDNA3-Flag载体的多克隆位点,选择BamHⅠ和XhoⅠ作为酶切位点,设计上游引物5'-CGGGATCCatgaaggcgggtgccacgtctatg-3'(划线部分为BamHⅠ位点)、下游引物5'-CCGCTCGAGtcag⁃gacttgaacacgtg-3'(划线部分为XhoⅠ位点),以反转录的cDNA为模板,PCR扩增CARP1基因片段。反应条件:95℃ 5 min;95℃ 30 s,58℃ 30 s,72℃90 s,30个循环;72℃ 5 min。1%琼脂糖凝胶电泳检测扩增产物,确定分子量正确后,回收目的基因。

1.3 CARP1基因真核表达载体的构建与鉴定

将回收的扩增产物和pcDNA3-Flag质粒分别用BamHⅠ/XhoⅠ双酶切,酶切产物经1%琼脂糖凝胶电泳后回收。将双酶切的目的基因与pcDNA3-Flag载体连接,连接产物转化大肠杆菌DH5α,氨苄西林平板培养过夜。挑选候选阳性克隆进行菌落PCR鉴定,提取阳性克隆质粒进行双酶切鉴定,鉴定后的克隆送奥科公司测序。Myc-CARP1构建采用亚克隆方法,构建至Myc-tag3B载体。

1.4 细胞培养、转染及免疫印迹分析

HCT116细胞、293T细胞用含10%胎牛血清的DMEM培养基于CO2细胞培养箱中常规培养。转染按说明书进行,转染前24 h将293T细胞接种于6 cm细胞培养板中。将质粒与200 μL生理盐水混合,再将2 μL Vigofect与200 μL生理盐水混合,静置混匀后将两者轻轻混合,室温放置15 min,加入培养板中,继续培养24 h后,用1×PBS洗细胞3次,用裂解液裂解后,加入SDS上样缓冲液[50 mmol/L Tris-HCl(pH6.8),2%SDS,0.1%溴酚蓝,10%甘油,2.5% β-巯基乙醇],沸水浴5 min,离心后取上清进行SDS-PAGE,电泳结束后转移至PVDF膜上,用5%脱脂奶粉室温孵育1 h,然后加入稀释的Flag特异抗体4℃孵育过夜。用TBST洗膜3次,加入稀释的HRP偶联的羊抗鼠IgG,室温孵育1 h,用TBST洗膜3次,暗室中显影。

1.5 免疫共沉淀分析

质粒Flag-RIP1、HA-Ubi与Myc-CARP1共转染293细胞,以仅转染Flag-RIP1、仅转染Flag-RIP1和HA-Ubi为对照。按上述方法收取细胞,用含2%SDS的细胞裂解液[2%SDS,150 mmol/L NaCl,10 mmol/LTris-HCl(pH8.0),2mmol/LNa3VO4,50 mmol/L NaF,1×蛋白酶体抑制剂]裂解细胞,沸水浴10 min,离心后取上清,加入10倍体积的稀释缓冲液[10 mmol/L Tris-HCl(pH8.0),150 mmol/L NaCl,2 mmol/L EDTA,1%Triton X-100],样品混匀后加入20 μL抗Flag抗体琼脂糖珠(Sigma公司)进行免疫共沉淀实验,在4℃冰箱中旋转孵育2 h,孵育结束后3000 r/min离心1 min,弃上清,沉淀用洗涤缓冲液[10 mmol/L Tris-HCl(pH8.0),1 mol/L NaCl,1 mmol/L EDTA,1%NP-40]800 μL重悬,重复3次,最后一次离心沉淀的珠子中加入1×SDS上样缓冲液,沸水浴5 min,利用免疫印迹对蛋白的泛素化进行检测。

1.6 萤光素酶活性检测

按照试剂盒说明书进行。细胞接种于24孔板中 ,将 质 粒 pcDNA3-Flag-CARP1(0.1 μg/孔)、NF-κB-luc(0.1 μg/孔)、pRL(0.002 μg/孔)共同转染293T细胞,18 h后加入10 ng/μL TNFα处理6 h,用PBS洗2次,在每孔中加入100 μL裂解缓冲液,室温轻摇15 min,取50 μL测定萤光素酶活性。

2 结果

2.1 人结肠癌细胞系HCT116总RNA的提取

用TRIzol法提取HCT116细胞系总RNA,从图1中可以看到提取的总RNA有清晰的5S、18S、28S条带。

2.2 CARP1基因的扩增

以HCT116细胞系的cDNA为模板扩增CARP1基因,扩增产物经1%琼脂糖凝胶电泳鉴定,在1000 bp左右出现明显的扩增条带(图2),与预期的CARP1基因长度一致。

2.3 重组pcDNA3-Flag-CARP1质粒的构建与鉴定

将双酶切的pcDNA3-Flag和目的片段CARP1连接,转入大肠杆菌,克隆长出后,用含氨苄西林的LB培养基进行菌液扩增,并用PCR检测是否含有CARP1片段。从图3A中可以看到1、2克隆中有CARP1插入片段;取1号克隆菌液提取质粒,经BamHⅠ和XhoⅠ双酶切后在1000 bp左右出现预期条带(图3B)。将1号克隆测序,比对发现CARP1测定序列与报道一致。

2.4 pcDNA3-Flag-CARP1在293T细胞中的表达

pcDNA3-Flag空载体和pcDNA3-Flag-CARP1质粒分别转染293T细胞,培养24 h后收集细胞,用裂解液裂解后经SDS-PAGE分离,Western印迹结果(图4)显示,与空载体对照相比,转染pcDNA3-Flag-CARP1的细胞中在相对分子质量30×103~55×103之间有一条特异性条带,与预期大小37×103相符,表明pcDNA3-Flag-CARP1在293T细胞中获得了表达。

图1 HCT116细胞总RNA的鉴定

图2 PCR扩增CARP1基因

图3 重组质粒的PCR(A)及酶切鉴定(B)

2.5 CARP1对RIP1泛素化及NF-κB转录活性的影响

从免疫共沉淀结果(图5A)可以看到,如果不加入CARP1,RIP1可见较弱的泛素化,而加入CARP1后RIP1泛素化明显增强。有文献报道,CARP1可以通过泛素化RIP1抑制TNFα激活NF-κB的功能。将pcDNA3-Flag空质粒或pcDNA3-Flag-CARP1和NF-κB-luc及pRL质粒共同转染细胞,4 h后换液,收细胞前6 h加入10 ng/mL TNFα刺激。从图5B可以看到,加入TNFα后,NF-κB活性增加了6倍,转染pcDNA3-Flag-CARP1后,TNFα引起的NF-κB升高的活性被明显抑制。这些结果提示我们,构建的pcDNA3-Flag-CARP1具有生物学活性。

图4 Western印迹鉴定CARP1在293T细胞中的表达

图5 CARP1活性检测

2.6 CARP1对结肠癌细胞系生长的影响

将pcDNA3-Flag空质粒或pcDNA3-Flag-CARP1分别转染相同数量的HCT116细胞,在24、48、72、96 h收取细胞计数并做图(图6),可以看到CARP1基因促进HCT116细胞的生长(P<0.05)。顺铂(cisplatin,CDDP)是化疗常用药物,可以抑制肿瘤细胞的生长。从图6我们可以看到,在细胞中加入CDDP(5 μg/mL),HCT116 细胞的生长受到了明显抑制;而细胞中过表达CARP1时,CDDP的生长抑制作用减弱(P<0.01)。进一步说明CARP1促进细胞生长,并可以部分抵抗化疗药物引起的细胞生长抑制作用。

图6 CARP1基因对细胞生长的影响

3 讨论

2004年El-Deiry等报道,CARP1可以泛素化caspase-8和-10,引起这2个蛋白通过蛋白酶体降解,从而抑制caspase-8和-10介导的凋亡[1]。CARP1含有一个RING锌指结构域,是泛素连接酶常见的结构域。CARP1的RING锌指结构域与牛小肠碱性磷酸酶(cIAP)结构域的同源性很高,而cIAP不具备降解caspase-8和-10的活性。文献还报道了CARP1可以泛素化从而降解抑癌基因p53,并降低p53ser20磷酸化水平[2-4]。另外,CARP1还参与到肿瘤坏死因子受体(TNFR)复合物中,通过蛋白酶体途径降解泛素化的RIP1,从而降低NF-κB的活性[5]。为了研究该基因的功能,我们从HCT116细胞cDNA文库中克隆了CARP1基因,构建了其真核表达载体pcDNA3-Flag-CARP1,瞬时转染293T细胞,利用Western印迹证实该表达载体能够在293T细胞中表达,最后利用体内泛素化实验及萤光素酶报告基因实验检测到构建的CARP1具有相应的生物学功能。另外,实验中还发现在HCT116中过表达CARP1可以促进HCT116细胞的增殖,并可部分抵抗顺铂引起的生长抑制,但机制并不清楚。以上结果说明CARP1可能参与肿瘤的发生、发展及耐药性的产生,为我们进一步研究CARP1的功能奠定了基础。

[1]McDonald E R,El-Deiry W S.Suppression of caspase-8-and-10-associated RING proteins results in sensitization to death ligandsand inhibition oftumorcellgrowth[J].Proc Natl Acad Sci USA,2004,101:6170-6175.

[2]Yang W,Rozan L M,McDonaldⅢE R,et al.CARPs are ubiquitin ligasesthatpromoteMDM2-independentp53 and phospho-p53ser20degradation[J].J Biol Chem,2007,282:3273-3281.

[3]Yang W,Dicker D T,Chen J,et al.CARPs enhance p53 turnover by degrading 14-3-3sigma and stabilizing MDM2[J].Cell Cycle,2008,7(5):670-682.

[4]Yang W,El-Deiry W S.CARPs are E3 ligases that target apicalcaspases and p53[J].CancerBiolTher,2007,6(11):1676-1683.

[5]Liao W,Fujita K I,Xiao Q,et al.CARP1 regulates induc⁃tion of NF-κB by TNFα[J].Curr Biol,2009,19(1):R17-R18.

[6]Liao W,Xiao Q,Tchikov V,et al.CARP-2 is an endo⁃some-associated ubiquitin ligase for RIP and regulates TNF-induced NF-κB activation[J].Curr Biol,2008,18(9):641-649.

猜你喜欢

泛素缓冲液结构域
血清蛋白醋酸纤维膜电泳缓冲液的筛选
新型醋酸纤维素薄膜电泳缓冲液的研究
蛋白质结构域划分方法及在线服务综述
卵磷脂/果胶锌凝胶球在3种缓冲液中的释放行为
重组绿豆BBI(6-33)结构域的抗肿瘤作用分析
组蛋白甲基化酶Set2片段调控SET结构域催化活性的探讨
蛋白泛素化和类泛素化修饰在植物开花时间调控中的作用
泛RNA:miRNA是RNA的“泛素”
泛素结合结构域与泛素化信号的识别
SCF E3泛素化连接酶的研究进展