MZTP02噬菌体tmp基因的鉴定:与尾巴装配相关的蛋白质*
2013-06-07宋少云陈维春李广宏
宋少云,廖 威,2,陈维春,3,李广宏
(1.中山大学生命科学学院//有害生物控制与资源利用国家重点实验室,广东广州510275;2.广西职业技术学院食品与生物技术系,广西南宁530226;3.广东医学院生化和分子生物研究所,广东湛江524023)
苏云金芽孢杆菌 (Bacillus thuringiensis)被广泛应用于防控鳞翅类昆虫,但是溶原性噬菌体的随机爆发对苏云金芽孢杆菌杀虫剂生产有很大的危害。苏云金芽孢杆菌83%的亚种都是溶原性噬菌体的寄主[1-2],噬菌体随机爆发的几率为15% ~30%,少数为50% ~80%,甚至可达100%[3]。由于噬菌体的随机爆发造成杀虫剂生产巨大损失,从1960年以来就开展了大量的研究[4],但到目前为止,还没获得有效的方法来抑制噬菌体的随机爆发。1984年,发现苏云金芽孢杆菌菌种H14细胞内有一个小DNA分子的存在,它是一个能够迁移的线性质粒[5];这个线性的DNA分子实际上对应的是溶源性噬菌体的前噬菌体形式。
目前只有3个从苏云金芽孢杆菌中分离的噬菌体 GIL01,Bam35和 GIL16,已进行了 DNA测序[5-7]。GIL01和Bam35属于复层噬菌体科,它们能够侵染很多革兰氏阳性细菌,在结构上只有少数几种核苷酸有差别。这3种噬菌体的基因组结构有着非常紧密的关联性[5],但对随机爆发噬菌体的机理仍然知之甚少。
噬菌体MZTP02是从苏云金芽孢杆菌菌株MZ1分离出来的[8]。它有一个20面体的头部、一条长的尾巴,但没有发现尾刺。噬菌体基因组已经测序,全长15717 bp, (G+C)含量为37.55%(GenBank,Accession No.AY894696)。序列分析表明两个40 bp长度内嵌终端的碱基重复率为65%,其功能为连结两端的基因组。噬菌体MZTP02基因组为包含tmp基因在内的20个开放读码框(ORFs),其中有9个编码噬菌体的尾巴蛋白质,还有2个终端酶亚体、运输蛋白质、头部蛋白质和尾巴组分等蛋白质。……
