鸡源性肠炎沙门氏菌的鉴定*
2012-11-13杜冬冬庄燕飞常维山
王 涛,王 亮,杜冬冬,庄燕飞,常维山
2.秦皇岛出入境检验检疫局,秦皇岛 066004
沙门氏菌是危害人类与畜禽等动物的一类病原菌,其血清型超过2 000个,我国已发现216个[1-2]。鉴于其危害性能够准确的鉴定沙门氏菌的基因型,对于沙门氏菌的防控与流行病学调查有重要意义。目前对于沙门氏菌的分类方法有多种比如分离培养、形态特征、生化反应和免疫学、16srRNA基因测序 方 法[3],ERIC-PCR 方 法、随 机 扩 增 多 态 性DNA分型技术(RAPD)、基因外重复序列-PCR(rep-PCR)等。但是分离培养、形态特征、生化反应和免疫学等方法均存在耗时长、特异性差、敏感度低等问题,难以满足现代细菌学研究的发展要求。16s rRNA 基因测序方法[3],ERIC-PCR方法、随机扩增多态性DNA分型技术(RAPD)、基因外重复序列-PCR(rep-PCR)等方法存在准确率低、不能够实现全球互享等缺点而多位点序列分型技术解决了上述难题。多位点序列分型 (multilocus sequence typing,MLST)是一种通过直接测定多个管家基因的核苷酸序列来发现细菌变异的分型方法。它由Maiden等[4]于1998年首次运用于脑膜炎奈瑟菌的分型,后来由于其结果精确并且易于传递而广泛应用于其他致病菌、真菌以及一些非致病菌。MLST有两种分析方法,一种是以等位基因编号和ST编号为基本分析单位,还有一种就是直接分析核苷酸序列。选择哪种方法取决于所要分析的细菌群体的构成[5]在分析 MLST数据之前首先要确定所研究细菌群体的克隆程度,然后再根据需要选择相应的分析方法。目前该方法已广泛应用于霍乱弧菌、空肠弯曲菌、葡萄球菌、单增李斯特菌等细菌的分型研究[6-7]。……
