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小菜蛾ISSR-PCR反应体系的建立与正交设计优化

2012-09-28杨家强王相晶郭兆将吴青君王少丽徐宝云张友军

植物保护 2012年6期
关键词:体系优化水平

杨家强, 王相晶, 郭兆将, 朱 勋, 吴青君*,谢 文, 王少丽, 徐宝云, 张友军

(1.东北农业大学生命科学学院,哈尔滨 150030;2.中国农业科学院蔬菜花卉研究所,北京 100081)

简单重复序列间区(inter simple sequence repeat,ISSR)是由 Zietkiewicz等人[1]开发的一种基于SSR的分子标记。这种新型方法用锚定的微卫星DNA为引物,即在SSR序列的3′端或5′端加上2~4个随机核苷酸,扩增反向排列的间隔不太长的2个SSR之间的序列,可以通过PCR技术揭示基因组中微卫星序列的变异。与微卫星及其他分子标记相比,ISSR标记具有操作简单,DNA用量少,可重复性好,成本低,呈孟德尔遗传,无须预知研究对象的基因组序列等特点,其所揭示的多态性比RFLP、RAPD和SSR更高,具有广泛的应用前景。这种方法常被应用于亲缘关系鉴定[2-4]、种质资源和遗传多样性研究[5-7],并被作为构建遗传图谱的工具[8]。

虽然ISSR-PCR具有重复性好的特点,但是IS-SR-PCR是基于PCR反应的分子标记方法,Mg2+浓度、dNTPs浓度、引物浓度以及Taq酶和模板DNA用量都会影响ISSR-PCR反应扩增效果[9],而且ISSR-PCR最佳反应体系在不同的物种中各不相同[10]。小菜蛾(Plutella xylostella)是影响十字花科蔬菜产量和质量最重要的害虫,因其繁殖率高、世代重叠严重、易产生抗药性,因此防治困难。Saw等利用mtCOI基因标记研究了澳大利亚小菜蛾,发现澳大利亚不同地理种群小菜蛾的mtDNA分化程度较低[11]。Endersby等通过对澳大利亚、新西兰等17个地区的小菜蛾进行SSR标记研究,发现澳大利亚小菜蛾种群与韩国、马来西亚种群存在较大的遗传分化[12]。由于ISSR-PCR各因素之间相互影响,为了保证ISSR-PCR结果的重复性和可靠性,必须搞清楚各因素之间的相互作用,所以非常有必要对小菜蛾ISSR-PCR反应体系进行优化,建立最佳反应体系。……

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