芥菜型油菜A9染色体黄籽基因区域BAC重叠群的构建

2012-09-25袁玉辉胡学芳刘显军刘旭东刘忠松

湖南农业科学 2012年11期

关键词：支架

王卓，袁玉辉，胡学芳，刘显军，刘旭东，刘忠松

（1.湖南农业大学生物科学技术学院，湖南长沙 410128；2.湖南农业大学农学院，湖南长沙 410128）

油菜是重要的油料作物，包括白菜型、芥菜型和甘蓝型三种类型，这三种类型的油菜具有共同的白菜来源的A 基因组[1]。A9 染色体是A 基因组中最长的染色体，长约37 Mb。A9 染色体上有控制种子大小[2]、种皮颜色[3]、硫苷合成[4－5]、油脂合成[6]等重要性状的基因。研究者对A9 染色体进行了大量研究，定位了大量SSR 标记，发现了许多基因[7-15]。Wang 等[16]公布了应用新一代测序方法测定的白菜基因组序列，为将这些标记、基因定位到A9 染色体对应BAC 和Scaffold 提供了基础。Mun 等[17]构建了由67468 个BAC 克隆组成的第一张白菜全基因组物理图谱，图谱上有242 个分布在10 个连锁群上的重叠群，长约717 Mb，对加速基因组序列分析、BAC 克隆序列的整合，以及芸薹属物种间的比较基因组研究起着重要的作用。

研究利用已构建的ZBjH BAC 文库，用A9 染色体上的标记进行PCR 步移筛选，构建重叠群，并与已测序的白菜A9 染色体物理图谱进行比较，分析芸薹属植物A9 染色体的进化和变异。构建芥菜型油菜A9 染色体黄籽基因区域物理图谱有助于黄籽候选基因的获得，为芥菜型油菜与白菜（白菜型油菜）、甘蓝型油菜A9 染色体进行比较物理作图提供基础，并为A9 染色体遗传图谱的加密和分子育种提供新的分子标记。