宋 双，黄银芝，董雷鸣，黄有军，曾燕如，吴智敏

（1.浙江农林大学 亚热带森林培育国家重点实验室培育基地，浙江 临安 311300；2.浙江省龙泉市林业局，浙江 龙泉 323700）

简单重复序列（simple sequence repeat，SSR）是一类一般由1～6个碱基组成的基元重复串联而成的脱氧核糖核酸（DNA）序列[1]，基元重复次数一般为10～50，同一类微卫星DNA可分布在基因组的不同位置上；基因组中SSR多态性较丰富，呈共显性遗传，所以可提供的信息量较高，结果稳定可靠[2]。SSR标记分为两大类，即基因组SSR（genomic SSR）和表达序列标签SSR（expression sequence tag-SSR，ESTSSR）。基因组SSR是基于基因组序列开发的，采用构建基因组文库的方法，开发耗时费力，而且因为探针的缘故，种类有一定的局限性；EST-SSR是指存在于基因表达序列内的SSR，不包括存在于内含子及非表达调控区之中的SSR[3-4]，它基于cDNA文库的构建及cDNA测序。Scott等[5]从5000条葡萄属Vitis EST中开发了124个SSR。EST-SSR标记不仅具有基因组SSR标记多态性高、共显性、重复性好的特点，而且开发成本相对低廉，在种属间具有良好的通用性[6]。另外，由于部分EST-SSR标记来自于基因的编码区，所以更容易获得基因表达的信息，可为功能基因的直接鉴定提供重要依据[7]。目前，该分子标记已被广泛应用于品种指纹鉴定[8-9]、遗传连锁图谱构建[10-11]、遗传多样性分析[12-13]和分子标记辅助育种[2，14-15]， 在诸如小麦 Triticum aestivum[16-17]， 大豆 Glycine max[18-19]， 葡萄 Vitis vinifera[5]， 胡椒 Lindera sp.[20]， 白菜 Brassica campestris[21]， 水稻 Oryza sativa[22]， 猕猴桃 Actinidia chinensis[23]等植物中已成功开发了EST-SSR标记，但尚无山核桃Carya cathayensis EST-SSR标记的报道。山核桃是浙江省重要的经济树种。近年来随着研究的深入，已陆续在山核桃中建立了扩增片段长度多态性……