根据2011年版《中国科技期刊引证报告（核心版）》显示，《湖南中医药大学学报》2010年中国科技期刊被引用指标：总被引频次676，在中医学和中医药类期刊中排名49；影响因子0.319，在中医学和中医药类期刊中排名44；他引率0.89，引用刊数194。

又据中国学术期刊影响因子年报（自然科学与工程技术·2011版）显示：《湖南中医药大学学报》总被引频次1817，影响因子0.467，影响因子学科排序51名；基金论文比0.37，他引率0.92。