1.伏牛山国家级自然保护区

位于中国河南省西峡、内乡、南召、栾川、嵩县、鲁山等6县境内。1997年12月经国务院批准为国家级自然保护区。总面积56024公顷。主要保护对象为天然阔叶林森林生态系统。

2.鸡公山国家级自然保护区

位于河南省信阳市境内，面积2917公顷。1988年晋升为国家级自然保护区。主要保护对象为亚热带森林植被过渡类型及珍稀野生动植物。区内生物资源丰富，有国家重点保护动植物大鲵、长尾雉、香果树等。

3.董寨国家级自然保护区

位于豫鄂两省交界的大别山北麓，距信阳市32km。2001年6月经国务院批准为国家级自然保护区。总面积4.68万公顷。区内分布有植物1879种，兽类37种，两栖爬行类44种，鸟类237种，其中国家重点保护鸟类39种，列入中日候鸟保护协定名录的有95种，被誉为“鸟类乐园”。

4.连康山国家级自然保护区

位于河南新县西部，地处大别山北麓。2005年被批准为国家级自然保护区。总面积2000公顷。区内有珍稀濒危植物44种，其中国家Ⅱ级保护植物9种，Ⅲ级保护植物15种。国家重点保护野生动物34种，列为国家Ⅰ级保护野生动物的有金钱豹、金雕、白鹳3种，国家Ⅱ级保护野生动物有31种。

5.金寨天马国家级自然保护区

地处安徽省金寨县，面积为28914公顷，地处大别山腹地。1998年8月由国务院批准成立。金寨天马国家级自然保护区是淮河支流史河、淠河的发源地和下游梅山、响洪甸两大水库的水源涵养地。主要保护对象为北亚热带常绿落叶阔叶林及珍稀动植物原麝、白冠长尾雉、金钱松、香果树等。

6.泗洪洪泽湖湿地国家级自然保护区

位于泗洪县东南部。2006年2月11日被国务院批准为国家级自然保护区，由原杨毛嘴湿地为中心的天然湿地生态系统、湖滨珍禽鸟类保护区、生态森林公园（休闲度假区）、生物多样化科普区、万亩水产养殖生态示范区和万亩无公害稻蟹立体养殖示范区等六大功能区组合而成，核心区面积近15万亩。保护区内动植物资源极为丰富，有浮游动物35科、63属、91种。

7.盐城沿海滩涂珍禽国家级自然保护区

位于江苏省盐城市沿海地区，面积45.3万公顷，1992年晋升为国家级自然保护区，同年加入联合国教科文组织国际“人与生物圈”保护区网。主要保护对象为滩涂湿地生态系统和以丹顶鹤为代表的多种珍禽。区内鸟类有315种，其中属国家一级保护的9种，二级保护的33种。每年在此越冬的丹顶鹤有800只左右，为全世界最大的丹顶鹤越冬地，也是国际濒危物种黑嘴鸥的重要繁殖地。区内还分布着众多的国家二级保护动物河鹿，数量之多为全国之最。

8.大丰麋鹿国家级自然保护区

位于江苏省大丰市东南，面积78000公顷。1997年晋升为国家级自然保护区。为典型的滨海湿地，主要湿地类型包括滩涂、时令河和部分人工湿地，还有大量林地、芦荡、沼泽地、盐裸地和森林草滩。大丰麋鹿国家级自然保护区是世界占地面积最大的麋鹿自然保护区，拥有世界最大的野生麋鹿种群，建立了世界最大的麋鹿基因库