《第三军医大学学报》为国内外公开发行的综合性医药卫生类学术期刊, 创刊于1979年, 现为半月刊。其复合影响因子 0.800、复合总被引频次 6419（2010年《中国学术期刊影响因子年报》）, 来稿 2708篇（2010年）, 刊稿 877篇（2010年）, 平均刊稿时间（从来稿到刊出）164天（2010年）, 稿件录用率35%左右。

《第三军医大学报》被国内外各大检索系统收录, 两度被评为国家期刊奖百种重点期刊, 为中国科技论文统计源期刊、中国自然科学类核心期刊和中国科学引文数据库（CSCD）核心库收录期刊。2008～2010年连续3年评为“中国百种杰出学术期刊”。

主要栏目有专家述评、专题报道、论著（军事医学、基础医学、临床医学、药学、预防医学、检验医学、生物医学工程等）、技术方法、研究快报、短篇论著、经验交流、疑难病例、个案与短篇和学术之窗等。

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