小拟南芥高盐胁迫诱导cDNA文库的构建与测序分析
2012-01-08院海英徐芳吕新华崔百明黄先忠
石河子大学学报(自然科学版) 2012年1期
院海英,徐芳,吕新华,崔百明,黄先忠
(石河子大学生命科学学院/石河子大学农业生物技术重点实验室,石河子832003)
小拟南芥高盐胁迫诱导cDNA文库的构建与测序分析
院海英,徐芳,吕新华,崔百明,黄先忠
(石河子大学生命科学学院/石河子大学农业生物技术重点实验室,石河子832003)
以新疆小拟南芥为材料,分离了小拟南芥经500mmol/L NaCl胁迫处理的幼苗总RNA,采用改良的SMART cDNA合成方法合成第一链cDNA,采用LD PCR的方法合成第二链cDNA,经BP反应重组到入门载体pDONR207上,构建了小拟南芥高盐胁迫的入门cDNA文库。文库插入片段平均大小为1.1kb,阳性克隆率为94%。文库经随机挑选克隆测序,生物信息学分析初步获得了10个有功能的基因,其中包含各种酶如水解酶、氧化还原酶等;功能蛋白如离子运输通道蛋白、胁迫诱导蛋白,细胞色素蛋白及激素受体蛋白基因等。可以利用入门文库构建各种目的cDNA文库,本研究为将来从小拟南芥中筛选耐盐基因奠定了基础。
新疆小拟南芥;耐盐;入门文库;表达文库;BP重组
早春短命植物,在新疆分布丰富。由于其生活史短,具有一定的抗寒、抗旱、耐盐碱能力,而备受关注。小拟南芥(Olimarabidopsis pumila)为无苞芥属(Olimarabidopsis),其亲源关系与模式植物拟南芥十分接近[1-2],且比拟南芥具有更好的耐盐性能[3-5],从小拟南芥中挖掘耐盐相关基因,并进行相关功能研究,不仅能丰富植物响应高盐胁迫的分子机理,也可利用耐盐基因培育耐盐作物品种。
对于基因组序列未知的物种,构建全长cDNA文库,是进一步开展分子生物学研究的基础。……
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