淋巴囊肿病毒mcp基因变异特征及其基因型分析
2011-09-13闫秀英吴灶和简纪常鲁义善孙修勤
闫秀英,吴灶和,简纪常,鲁义善,孙修勤
(1.广东海洋大学广东省水产经济动物病原生物学及流行病学重点实验室,广东湛江524025; 2.国家海洋局第一海洋研究所海洋生态研究中心,山东青岛266061)
淋巴囊肿病毒mcp基因变异特征及其基因型分析
闫秀英1,吴灶和1,简纪常1,鲁义善1,孙修勤2
(1.广东海洋大学广东省水产经济动物病原生物学及流行病学重点实验室,广东湛江524025; 2.国家海洋局第一海洋研究所海洋生态研究中心,山东青岛266061)
淋巴囊肿病毒是引起多种海、淡水鱼淋巴囊肿病的病原,且不同淋巴囊肿病毒分离株间存在一定的差异。本文对25株淋巴囊肿病毒分离株mcp基因的变异特征进行分析,结果表明:分离自同一宿主的淋巴囊肿病毒mcp基因序列并非完全一致,有些同宿主分离株间存在着较少的变异,其MCP蛋白序列间的变异位点多位于不规则结构域、属于非蛋白相互作用位点;分属不同基因型淋巴囊肿病毒分离株MCP蛋白序列间的变异位点也多位于不规则结构域,变异位点为蛋白相互作用位点的比率仅占21.98%。金头鲷淋巴囊肿病毒分离株LCDV-sa是一种新的淋巴囊肿病毒基因型,此25株淋巴囊肿病毒可分为7个基因型。对淋巴囊肿病毒变异的研究,可加深对其感染机制的认识,有助于了解其传播途径,可为淋巴囊肿病的防控提供重要的理论依据。
淋巴囊肿病毒;mcp基因;变异;基因型
淋巴囊肿病毒(Lymphocystis disease virus, LCDV)属于虹彩病科(Iridoviridae)、淋巴囊肿病毒属(L ym phocystivirus)[1],可引起全球140多种淡、海水鱼发生淋巴囊肿病[2-3],也可在多种海、淡水鱼细胞中扩增并引起宿主细胞产生病变现象[4-5]。……