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QSAR中ANN用于研究变量选择方法的回顾和比较

2011-09-03蒋益林

哈尔滨工业大学学报 2011年10期
关键词:方法模型

杨 蕾,王 鹏,王 虹,3,蒋益林

(1.哈尔滨工业大学 基础交叉与科学技术研究院,150001哈尔滨,leiyang84@vip.sina.com;2.哈尔滨工业大学市政环境工程学院,150090哈尔滨;3.黑龙江大学化学化工与材料学院,150080哈尔滨)

在环境化学领域,QSAR是进行有毒化学品生态风险评价的重要手段之一.目前,QSAR研究中常用的方法有多元线性回归分析(MLR)、人工神经网络(ANN)等,后者在处理非线性关系方面有着非常强大的功能,而化合物的结构和毒性之间大多存在非线性的关系,使ANN成为QSAR研究的热点[1-3].

由输入变量ANN便能预测输出变量,但网络内部的作用机理往往被忽略,因而被认为是个黑箱模型.近年来,研究者提出了许多方法来描述变量在神经网络QSAR模型中所起的作用,然而大多数方法被用来消除不相关变量,因而被称为修剪方法[4-6].简单地说,修剪算法就是由具有高度联结的网络(i.e.神经元之间有许多连接)开始,逐步移除弱连接,或当连接移除时,网络误差无明显变化的连接.事实上,在QSAR建模中,不仅需要好的预测能力,还要了解每个输入变量对输出的相对贡献大小.本文回顾和比较了用ANN建模并解释QSAR模型的6种方法,这些方法被用来确定每个输入变量对输出的贡献,因而不是修剪算法.

以35种硝基化合物对黑呆头鱼96 h的生物毒性为研究对象,探讨了ANN中引入变量选择方法后,QSAR模型的解释能力.结果表明,偏微分方法分析所建模型能得出最为全面准确的结果,模型具有良好的预测和解释能力;其次为分布图……

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